RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	CHRNG	P07510	517 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	TUB	P50607	506 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	BLMH	Q13867	455 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	CYS1	Q717R9	158 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	URGCP	Q8TCY9	931 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	COG4	Q9H9E3	785 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	SOX13	Q9UN79	622 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	LRPAP1	P30533	357 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	SERPINB8	P50452	374 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	CTBP1	Q13363	440 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	TUBB3	Q13509	450 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	VPS39	Q96JC1	886 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	COPA	P53621	1224 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	LIMK2	P53671	638 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	CBLB	Q13191	982 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	CUL3	Q13618	768 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	GRM3	Q14832	879 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	13.13	□□□□□ -0.31	1e-6	■■■■□ 22.1
SMTN-222	ENST00000612341	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	SGF29	Q96ES7	293 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	GBA3	Q9H227	469 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	PMPCB	O75439	489 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	SERPINB5	P36952	375 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	LHX1	P48742	406 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	CNTD1	Q8N815	330 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	MAPK15	Q8TD08	544 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	HTT	P42858	3142 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	DPPA5	A6NC42	116 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	MAP3K7	O43318	606 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	FBXO21	O94952	628 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	PGF	P49763	221 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM135	Q86UB9	458 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	TLK1	Q9UKI8	766 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	HAS3	O00219	553 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	MAGEC1	O60732	1142 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	VAPB	O95292	243 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	ANPEP	P15144	967 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	GRK2	P25098	689 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	MPST	P25325	297 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	KLC1	Q07866	573 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	SEMA3B	Q13214	749 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	ITGA7	Q13683	1181 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	SEPT6	Q14141	434 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	PCSK7	Q16549	785 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	BNIPL	Q7Z465	357 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	OR52B2	Q96RD2	323 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	OMD	Q99983	421 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	CASS4	Q9NQ75	786 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341		A0A088AWK7	358 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	OR4Q2	P0C623	313 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	EPHA3	P29320	983 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	RAP1GDS1	P52306	607 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	MPP1	Q00013	466 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	NXN	Q6DKJ4	435 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	MARK4	Q96L34	752 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	MPP6	Q9NZW5	540 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.8 ms