RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, human

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		27.55	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		27.55	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	FZD4	Q9ULV1	537 aa		27.55	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		27.55	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		27.55	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	MCF2L	O15068	1137 aa		27.54	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	SYP	P08247	313 aa		27.54	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	TPI1	P60174	286 aa		27.54	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		27.54	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	VSTM4	Q8IW00	320 aa		27.54	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		27.54	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		27.54	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315		A0A087X0T9	212 aa		27.53	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315		A0A1B0GTW7	788 aa		27.53	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		27.53	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	DAPK3	O43293	454 aa		27.53	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	FSBP	O95073	299 aa		27.53	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	FAM228B	P0C875	321 aa		27.53	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	GOT1	P17174	413 aa		27.53	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	ENG	P17813	658 aa		27.53	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	GLDC	P23378	1020 aa		27.53	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	HTR7	P34969	479 aa		27.53	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		27.53	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		27.53	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		27.53	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	C4orf47	A7E2U8	309 aa		27.52	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315		K7ERQ8	282 aa		27.52	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	MAPK8	P45983	427 aa		27.52	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	DNA2	P51530	1060 aa		27.52	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		27.52	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	ACAP1	Q15027	740 aa		27.52	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	ARTN	Q5T4W7	220 aa		27.52	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		27.52	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		27.52	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		27.52	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	TRIM7	Q9C029	511 aa		27.52	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	TRIM5	Q9C035	493 aa		27.52	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	CEP44	Q9C0F1	390 aa		27.52	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	THAP2	Q9H0W7	228 aa		27.52	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	DYRK4	Q9NR20	520 aa		27.52	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		27.52	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	MIP	P30301	263 aa		27.51	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	ACVRL1	P37023	503 aa		27.51	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		27.51	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		27.51	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		27.5	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	ZMPSTE24	O75844	475 aa		27.5	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	PRNP	P04156	253 aa		27.5	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	KCNA4	P22459	653 aa		27.5	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	CHRNA3	P32297	505 aa		27.5	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	GALC	P54803	685 aa		27.5	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		27.5	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		27.5	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		27.5	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		27.5	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		27.5	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	DNAJC7	Q99615	494 aa		27.5	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	NUP85	Q9BW27	656 aa		27.5	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	CAPN10	Q9HC96	672 aa		27.5	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		27.5	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		27.5	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		27.5	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	NEU3	Q9UQ49	428 aa		27.5	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	ARHGAP33	O14559	1287 aa		27.49	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	AKR1B10	O60218	316 aa		27.49	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	ARF5	P84085	180 aa		27.49	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		27.49	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		27.49	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	27.49	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		27.49	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	BIRC7	Q96CA5	298 aa		27.49	■■□□□ 1.99
BRD4-208	ENST00000597315	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		27.48	■■□□□ 1.99

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