RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 AIF1P55008 147 aa16.46■□□□□ 0.23
EFTUD2-215ENST00000589825 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC14A1Q13336 389 aa16.46■□□□□ 0.23
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
EFTUD2-215ENST00000589825 TMC6Q7Z403 805 aa16.46■□□□□ 0.23
EFTUD2-215ENST00000589825 AADATQ8N5Z0 425 aa16.46■□□□□ 0.23
EFTUD2-215ENST00000589825 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa16.46■□□□□ 0.23
EFTUD2-215ENST00000589825 TRIM11Q96F44 468 aa16.46■□□□□ 0.23
EFTUD2-215ENST00000589825 EPAS1Q99814 870 aa16.46■□□□□ 0.23
EFTUD2-215ENST00000589825 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.23
EFTUD2-215ENST00000589825 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM248Q9NWD8 314 aa16.46■□□□□ 0.23
EFTUD2-215ENST00000589825 TAS2R14Q9NYV8 317 aa16.46■□□□□ 0.23
EFTUD2-215ENST00000589825 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
EFTUD2-215ENST00000589825 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 A0A1W2PQJ5 194 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC7A4O43246 635 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 CREB3O43889 395 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 RAMP2O60895 175 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 RNF8O76064 485 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 PRNPP04156 253 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SKILP12757 684 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 EPHB2P29323 1055 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 L1CAMP32004 1257 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 CHRNA3P32297 505 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 DNA2P51530 1060 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 C21orf59P57076 290 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SCAPQ12770 1279 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 POM121L1PQ3SYA9 428 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 C22orf39Q6P5X5 142 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 DEFB124Q8NES8 71 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 OR2I1PQ8NGU4 316 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 CPLX3Q8WVH0 158 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF653Q96CK0 615 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SYT11Q9BT88 431 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 TTYH3Q9C0H2 523 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 MAGEH1Q9H213 219 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 GAREM1Q9H706 876 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 TM9SF3Q9HD45 589 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 OSGEPQ9NPF4 335 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 PPM1HQ9ULR3 514 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SCINQ9Y6U3 715 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 PCDH15Q96QU1 1955 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SPTBN2O15020 2390 aa16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 LAMA1P25391 3075 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 CACNA1EQ15878 2313 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 A0A1B0GVT2 93 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 A0A1W2PPC4 97 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM72CH0Y354 149 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 K7ERQ8 282 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 MYBL1P10243 752 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 GLDCP23378 1020 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 GRIA4P48058 902 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 CCR5P51681 352 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ADPRHP54922 357 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SEMA3BQ13214 749 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 MAMLD1Q13495 774 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC45A4Q5BKX6 768 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM72AQ5TYM5 149 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 MANEALQ5VSG8 457 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM72DQ6L9T8 149 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM72BQ86X60 149 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 PPP1R16AQ96I34 528 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 CEP44Q9C0F1 390 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 TNKS2Q9H2K2 1166 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 KDM4CQ9H3R0 1056 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 DONSONQ9NYP3 566 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 IFNKQ9P0W0 207 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF212Q9UDV6 495 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SARDHQ9UL12 918 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 FZD10Q9ULW2 581 aa16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 UPK3BL1B0FP48 263 aa16.43■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 UPK3BL2E5RIL1 263 aa16.43■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 IGHV4-34P06331 123 aa16.43■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 DRD3P35462 400 aa16.43■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 RACK1P63244 317 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ZBED6P86452 979 aa16.43■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 CNTN1Q12860 1018 aa16.43■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 HLA-BQ31612 363 aa16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms