RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC6A18	Q96N87	628 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	EBF2	Q9HAK2	575 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	WASF3	Q9UPY6	502 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479		H0Y8X5	98 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	FLRT2	O43155	660 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	CBFA2T3	O75081	653 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	RHOQ	P17081	205 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	GLDC	P23378	1020 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	RRM1	P23921	792 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	CTSK	P43235	329 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF165	P49910	485 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	METAP1	P53582	386 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	HDAC4	P56524	1084 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	GNA12	Q03113	381 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	CNTN1	Q12860	1018 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ST3GAL2	Q16842	350 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ARSI	Q5FYB1	569 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ARTN	Q5T4W7	220 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	LAYN	Q6UX15	382 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		9.61	□□□□□ -0.87
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KIFC3-231	ENST00000567479	TMIE	Q8NEW7	156 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	SERAC1	Q96JX3	654 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	CDC6	Q99741	560 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	DYRK4	Q9NR20	520 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	IL36A	Q9UHA7	158 aa		9.61	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	MYO6	Q9UM54	1294 aa		9.61	□□□□□ -0.87
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KIFC3-231	ENST00000567479	C10orf142	B7Z368	130 aa		9.6	□□□□□ -0.87
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KIFC3-231	ENST00000567479	TLR4	O00206	839 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
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KIFC3-231	ENST00000567479	LAT	O43561	262 aa		9.6	□□□□□ -0.87
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KIFC3-231	ENST00000567479	MAGEC1	O60732	1142 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ZMPSTE24	O75844	475 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	LRIG2	O94898	1065 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	PRNP	P04156	253 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	WNT1	P04628	370 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	CTSL	P07711	333 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	DES	P17661	470 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	NUDT1	P36639	197 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ETFB	P38117	255 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	PI4KA	P42356	2102 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	MAPKAPK2	P49137	400 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	CCT8	P50990	548 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	DNA2	P51530	1060 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ARF5	P84085	180 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	STAT4	Q14765	748 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	CARD16	Q5EG05	197 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	AGBL4	Q5VU57	503 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		9.6	□□□□□ -0.87
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KIFC3-231	ENST00000567479	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	MON1B	Q7L1V2	547 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	GLRX5	Q86SX6	157 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM72B	Q86X60	149 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC185	Q8N715	623 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	NTAN1	Q96AB6	310 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		9.6	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	CEP44	Q9C0F1	390 aa		9.6	□□□□□ -0.87

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