RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SKA1Q96BD8 255 aa21.72■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BTN2A3PQ96KV6 586 aa21.72■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPATA17Q96L03 361 aa21.72■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.72■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa21.72■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa21.72■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SHROOM3Q8TF72 1996 aa21.72■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KRT16P08779 473 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MYL2P10916 166 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GRK2P25098 689 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 USP46P62068 366 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EFEMP1Q12805 493 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPR17Q13304 367 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 POTEHQ6S545 545 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IPMKQ8NFU5 416 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPATA22Q8NHS9 363 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FICDQ9BVA6 458 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WWP1Q9H0M0 922 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MPP6Q9NZW5 540 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HAO1Q9UJM8 370 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRIM33Q9UPN9 1127 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PROCP04070 461 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RENBPP51606 427 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C16orf46Q6P387 395 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FUT10Q6P4F1 479 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF683Q8IZ20 524 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AGAP2Q99490 1192 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NDFIP2Q9NV92 336 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM248Q9NWD8 314 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MARCH5Q9NX47 278 aa21.71■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PITPNM1O00562 1244 aa21.7■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HLA-DQB2P05538 268 aa21.7■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 T-ENOLP0DO92 83 aa21.7■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NMBRP28336 390 aa21.7■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC8A1P32418 973 aa21.7■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC11A1P49279 550 aa21.7■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MNAT1P51948 309 aa21.7■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARPP19P56211 112 aa21.7■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IRX4P78413 519 aa21.7■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KRT72Q14CN4 511 aa21.7■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UGP2Q16851 508 aa21.7■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MS4A13Q5J8X5 152 aa21.7■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM91A1Q658Y4 838 aa21.7■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MBLAC2Q68D91 279 aa21.7■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FSTL4Q6MZW2 842 aa21.7■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NPAS4Q8IUM7 802 aa21.7■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FSD1LQ9BXM9 530 aa21.7■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MTMR11A4FU01 709 aa21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GSRP00390 522 aa21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SERPINE1P05121 402 aa21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SERPINB3P29508 390 aa21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADRA1AP35348 466 aa21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MGAT5BQ3V5L5 792 aa21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANKS3Q6ZW76 656 aa21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NOD2Q9HC29 1040 aa21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MARCH2Q9P0N8 246 aa21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PTPN4P29074 926 aa21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 POLD2P49005 469 aa21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CTC1Q2NKJ3 1217 aa21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C10orf120Q5SQS8 335 aa21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NSMCE1Q8WV22 266 aa21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRKD2Q9BZL6 878 aa21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC25A51Q9H1U9 297 aa21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM96AQ9H5X1 160 aa21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MID2Q9UJV3 735 aa21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 STK38LQ9Y2H1 464 aa21.69■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NUP205Q92621 2012 aa21.68■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CBX6O95503 412 aa21.68■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PAMP19021 973 aa21.68■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RING1Q06587 406 aa21.68■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TAF10Q12962 218 aa21.68■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPNMBQ14956 572 aa21.68■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCLAFQ15004 111 aa21.68■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPM1JQ5JR12 505 aa21.68■■□□□ 1.06
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DENND5AQ6IQ26 1287 aa21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.3 ms