RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561085.1

SEMA4B-218, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 4

Gene SEMA4B, Length 582 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-218ENST00000561085 IL4RP24394 825 aa23.51■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 ZBTB16Q05516 673 aa23.51■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 AFMIDQ63HM1 303 aa23.51■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 KIAA1328Q86T90 577 aa23.51■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 KBTBD6Q86V97 674 aa23.51■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 CACUL1Q86Y37 369 aa23.51■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 MAP7D3Q8IWC1 876 aa23.51■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 LZTR1Q8N653 840 aa23.51■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 SLC39A8Q9C0K1 460 aa23.51■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 LACRTQ9GZZ8 138 aa23.51■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 SALL4Q9UJQ4 1053 aa23.51■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 CYP8B1Q9UNU6 501 aa23.51■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 VPS13AQ96RL7 3174 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 PRR23AA6NEV1 266 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 BCKDHBP21953 392 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 TPMTP51580 245 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 MMRN1Q13201 1228 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 DPYSL3Q14195 570 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 LPAL2Q16609 132 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 PLK5Q496M5 336 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 LRRC38Q5VT99 294 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 Q6ZVU0 165 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 ASCL5Q7RTU5 278 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 NPWQ8N729 165 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 CCDC112Q8NEF3 446 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 DESI2Q9BSY9 194 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 CALN1Q9BXU9 219 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 CEP44Q9C0F1 390 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 CD93Q9NPY3 652 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 KLHL11Q9NVR0 708 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 HYOU1Q9Y4L1 999 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 ACTL7AQ9Y615 435 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 ALG6Q9Y672 507 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 DUSP10Q9Y6W6 482 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 CEP192Q8TEP8 1941 aa23.5■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa23.49■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 ARHGAP42A6NI28 874 aa23.49■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 MCF2LO15068 1137 aa23.49■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 MAP3K13O43283 966 aa23.49■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 BUB1O43683 1085 aa23.49■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 SPOPO43791 374 aa23.49■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 DNTTP04053 509 aa23.49■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 LAIR1Q6GTX8 287 aa23.49■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 C22orf39Q6P5X5 142 aa23.49■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 TMCO3Q6UWJ1 677 aa23.49■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa23.49■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 RHOT1Q8IXI2 618 aa23.49■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 TXLNBQ8N3L3 684 aa23.49■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 OR8D1Q8WZ84 308 aa23.49■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 ETNK2Q9NVF9 386 aa23.49■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 SCML1Q9UN30 329 aa23.49■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 ALOX15BO15296 676 aa23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 BNIP3LO60238 219 aa23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 RHOBTB1O94844 696 aa23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 IGLV3-19P01714 112 aa23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 KDELR1P24390 212 aa23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 MRE11P49959 708 aa23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 ELF2Q15723 593 aa23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 CST6Q15828 149 aa23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 C11orf63Q6NUN7 778 aa23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 SLC36A4Q6YBV0 504 aa23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 LEKR1Q6ZMV7 388 aa23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 DSG4Q86SJ6 1040 aa23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 LRRC8AQ8IWT6 810 aa23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 OR2A12Q8NGT7 310 aa23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 TPCN2Q8NHX9 752 aa23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 RAPGEF5Q92565 580 aa23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 CCDC114Q96M63 670 aa23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 ZNF670Q9BS34 389 aa23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 GPR179Q6PRD1 2367 aa23.48■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 ARHGAP6O43182 974 aa23.47■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 CD6P30203 668 aa23.47■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 OXTRP30559 389 aa23.47■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 SLC8A1P32418 973 aa23.47■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 KIF5AQ12840 1032 aa23.47■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa23.47■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 PMS2CLQ68D20 193 aa23.47■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 NETO2Q8NC67 525 aa23.47■■□□□ 1.35
SEMA4B-218ENST00000561085 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms