RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	TPM2	P07951	284 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CLTB	P09497	229 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	BCAT1	P54687	386 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CTBP1	Q13363	440 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	E2F2	Q14209	437 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	NPY5R	Q15761	445 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ADIPOQ	Q15848	244 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SHC4	Q6S5L8	630 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SZRD1	Q7Z422	152 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	TAGAP	Q8N103	731 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	GDAP1	Q8TB36	358 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	MGARP	Q8TDB4	240 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF653	Q96CK0	615 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	R3HDM4	Q96D70	268 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC46	Q96FV0	321 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CALML4	Q96GE6	196 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	C5orf34	Q96MH7	638 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	TSGA13	Q96PP4	275 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	MXD3	Q9BW11	206 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	GLOD4	Q9HC38	313 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	XPR1	Q9UBH6	696 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	NFU1	Q9UMS0	254 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	DAPP1	Q9UN19	280 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957		E7EVH7	732 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957		H7C1Q1	480 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDH17	O14917	1159 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SRGAP2	O75044	1071 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	B3GALNT1	O75752	331 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	GAS8-AS1	O95177	125 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	NPS	P0C0P6	89 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	RXRA	P19793	462 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ADORA2A	P29274	412 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	BSG	P35613	385 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC11A2	P49281	568 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF132	P52740	706 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	UCP3	P55916	312 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	WNT3	P56703	355 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	GALNT2	Q10471	571 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	MYO1E	Q12965	1108 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	PTP4A2	Q12974	167 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	COG2	Q14746	738 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	MORF4L2	Q15014	288 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP1B1	Q16678	543 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	FCRL6	Q6DN72	434 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	USP49	Q70CQ1	688 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	NUP93	Q8N1F7	819 aa		3	□□□□□ -1.93

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