RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559850.5

RABGGTA-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-211ENST00000559850 DESP17661 470 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 MAPKAPK2P49137 400 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 GALCP54803 685 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 SEMA3BQ13214 749 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 C22orf39Q6P5X5 142 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 CPNE8Q86YQ8 564 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 NETO1Q8TDF5 533 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 OR8D1Q8WZ84 308 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 DNAJC7Q99615 494 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 OMDQ99983 421 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 NUP85Q9BW27 656 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 KLC2Q9H0B6 622 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 DOCK9Q9BZ29 2069 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 C4orf47A7E2U8 309 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 RAMP2O60895 175 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 MFAP3LO75121 409 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 RNF8O76064 485 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 CD160O95971 181 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 C7P10643 843 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ENGP17813 658 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 KCNA4P22459 653 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 IL1R2P27930 398 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 DRD3P35462 400 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 VASPP50552 380 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 DNA2P51530 1060 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 TPI1P60174 286 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 TRIM14Q14142 442 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 SMTNL2Q2TAL5 461 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 KCNT1Q5JUK3 1230 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 SYCP2LQ5T4T6 812 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF783Q6ZMS7 281 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 GAS2L3Q86XJ1 694 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF354CQ86Y25 554 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 CADM4Q8NFZ8 388 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 OR8K1Q8NGG5 319 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 OR2A12Q8NGT7 310 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 FNIP1Q8TF40 1166 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 FOXJ1Q92949 421 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 EPAS1Q99814 870 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 TRIM5Q9C035 493 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ZWILCHQ9H900 591 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ABHD10Q9NUJ1 306 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ANAPC7Q9UJX3 599 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC30A4O14863 429 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 PRPSAP2O60256 369 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ADH1BP00325 375 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 CYP1A2P05177 515 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 GOT1P17174 413 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 C5AR1P21730 350 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 AIF1P55008 147 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 DUOXA1Q1HG43 343 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 UAP1L1Q3KQV9 507 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 WDR45BQ5MNZ6 344 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ERMARDQ5T6L9 678 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 RETSATQ6NUM9 610 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC23A3Q6PIS1 610 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 NCEH1Q6PIU2 408 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 LAYNQ6UX15 382 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 USP30Q70CQ3 517 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 OR6K2Q8NGY2 324 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 HSPH1Q92598 858 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ARRDC3Q96B67 414 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 BIRC7Q96CA5 298 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 HMCESQ96FZ2 354 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 TM6SF2Q9BZW4 377 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 DEF6Q9H4E7 631 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 SGK2Q9HBY8 427 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 SPTLC3Q9NUV7 552 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 PPM1HQ9ULR3 514 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 SCML1Q9UN30 329 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC6A14Q9UN76 642 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 RASA4BC9J798 803 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 MCF2LO15068 1137 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 RASA4O43374 803 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms