RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 PIGKQ92643 395 aa21.38■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 VPS45Q9NRW7 570 aa21.38■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 SERGEFQ9UGK8 458 aa21.38■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 ACTL7AQ9Y615 435 aa21.38■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 ADH1BP00325 375 aa21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 IL1BP01584 269 aa21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF806P0C7X5 589 aa21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 SLC8A1P32418 973 aa21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 ACSL1P33121 698 aa21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 SLC20A2Q08357 652 aa21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 DPYSL2Q16555 572 aa21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 BOLA3Q53S33 107 aa21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 USP30Q70CQ3 517 aa21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 DSG4Q86SJ6 1040 aa21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 CPNE8Q86YQ8 564 aa21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 OR2A12Q8NGT7 310 aa21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 HMCESQ96FZ2 354 aa21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 TNKS2Q9H2K2 1166 aa21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 OSGEPQ9NPF4 335 aa21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 FBXL12Q9NXK8 326 aa21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 HPCAL4Q9UM19 191 aa21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 A0A1W2PP55 124 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 RASA4BC9J798 803 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 MCF2LO15068 1137 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 ALOX15BO15296 676 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 DAPK3O43293 454 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 RASA4O43374 803 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 PROSCO94903 275 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 CD160O95971 181 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 RARAP10276 462 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 SSR1P43307 286 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 METAP1P53582 386 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 LMNB2Q03252 620 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 PARP15Q460N3 678 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 TCEAL6Q6IPX3 200 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF354CQ86Y25 554 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 SYT12Q8IV01 421 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 AADATQ8N5Z0 425 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 CADM4Q8NFZ8 388 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 TEKT4Q8WW24 435 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 FOXJ1Q92949 421 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 TCEAL3Q969E4 200 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC114Q96M63 670 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 PANX2Q96RD6 677 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 CEP44Q9C0F1 390 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 KLC2Q9H0B6 622 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 BTBD1Q9H0C5 482 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM74BQ9NUR3 256 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 DONSONQ9NYP3 566 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 SARDHQ9UL12 918 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 CHD5Q8TDI0 1954 aa21.36■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 DMXL1Q9Y485 3027 aa21.35■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 GON4LQ3T8J9 2241 aa21.35■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 KDELR3O43731 214 aa21.35■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 ERCC2P18074 760 aa21.35■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 C5AR1P21730 350 aa21.35■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 HCAR3P49019 387 aa21.35■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 DPYSQ14117 519 aa21.35■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 LEKR1Q6ZMV7 388 aa21.35■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 SLC35G2Q8TBE7 412 aa21.35■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 OMDQ99983 421 aa21.35■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 PILRBQ9UKJ0 227 aa21.35■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 PPM1HQ9ULR3 514 aa21.35■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 NUMA1Q14980 2115 aa21.34■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 CEP250Q9BV73 2442 aa21.34■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa21.34■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 MEI4A8MW99 385 aa21.34■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 PATE3B3GLJ2 98 aa21.34■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 H3BRJ5 948 aa21.34■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 SEMA4FO95754 770 aa21.34■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 CTSLP07711 333 aa21.34■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 ARL4AP40617 200 aa21.34■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 SERINC3Q13530 473 aa21.34■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 POM121L1PQ3SYA9 428 aa21.34■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 POLNQ7Z5Q5 900 aa21.34■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 HDDC3Q8N4P3 179 aa21.34■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
TMOD3-203ENST00000558455 NPWQ8N729 165 aa21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms