RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 P2RY11Q96G91 374 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ZFYVE19Q96K21 471 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 NELL2Q99435 816 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 P2RY13Q9BPV8 354 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 HERPUD2Q9BSE4 406 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 CARD6Q9BX69 1037 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 CEP44Q9C0F1 390 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 PCDH9Q9HC56 1237 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 PLK2Q9NYY3 685 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 PAK5Q9P286 719 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 SEPT3Q9UH03 358 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 PLA2G4CQ9UP65 541 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 OR51B4Q9Y5P0 310 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 AP3B1O00203 1094 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 KCNN4O15554 427 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 CISD3P0C7P0 127 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 IL9P15248 144 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 DRD1P21728 446 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 CA4P22748 312 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 HLA-FP30511 346 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 FDFT1P37268 417 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 CSKP41240 450 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 MMP13P45452 471 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 IRAK1P51617 712 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 DRG2P55039 364 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ECT2LQ008S8 904 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 CAV1Q03135 178 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 TFF2Q03403 129 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 PRKCQQ04759 706 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 SNX1Q13596 522 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 PTK6Q13882 451 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 PRPSAP1Q14558 356 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ZNF235Q14590 738 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 GRM3Q14832 879 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 SLC14A2Q15849 920 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 FBXO43Q4G163 708 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 FSCBQ5H9T9 825 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 NPNTQ6UXI9 565 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 CEP128Q6ZU80 1094 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 PLPP6Q8IY26 295 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 TEX26Q8N6G2 289 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 TERB1Q8NA31 727 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 UBXN4Q92575 508 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 MYEOVQ96EZ4 313 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ALG14Q96F25 216 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ASIC4Q96FT7 647 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 LMLNQ96KR4 655 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 SPATA13Q96N96 652 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ASB2Q96Q27 587 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 KRT12Q99456 494 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 LGMNQ99538 433 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 IL12RB2Q99665 862 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 TMEM121Q9BTD3 319 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 TSPYL1Q9H0U9 437 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 USP29Q9HBJ7 922 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 GTSE1Q9NYZ3 720 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 WNT16Q9UBV4 365 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 METRNQ9UJH8 293 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 DUSP12Q9UNI6 340 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 HS3ST2Q9Y278 367 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 A0A0D9SEW6 157 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 TBC1D3BA6NDS4 549 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 RNF103O00237 685 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ZMPSTE24O75844 475 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ANXA9O76027 345 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 KAT7O95251 611 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 KRT14P02533 472 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 DLDP09622 509 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ITIH2P19823 946 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 SP100P23497 879 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 RBL1P28749 1068 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 CTHP32929 405 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 CD70P32970 193 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 OPRD1P41143 372 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 CSNK1DP48730 415 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms