RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC130P13994 396 aa8.62□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 RFC2P35250 354 aa8.62□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 S100A3P33764 101 aa8.61□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 CNTN2Q02246 1040 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 SPIDRQ14159 915 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC55Q6ZSA7 311 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 PROX1Q92786 737 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 HAS1Q92839 578 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 OTCP00480 354 aa8.61□□□□□ -1.03
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