RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550155.5

CNOT2-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2

Gene CNOT2, Length 842 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-222	ENST00000550155	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	ICA1	Q05084	483 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155		Q6ZSV7	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	CEP76	Q8TAP6	659 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	LMLN	Q96KR4	655 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	APOLD1	Q96LR9	279 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	FRG2B	Q96QU4	278 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	KLHL31	Q9H511	634 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	EYA2	O00167	538 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	MMP3	P08254	477 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	CYP4B1	P13584	511 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	SERPINF1	P36955	418 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	CLCNKB	P51801	687 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	PMS2	P54278	862 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	CDH12	P55289	794 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	HYAL1	Q12794	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	TTC22	Q5TAA0	569 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	RMI1	Q9H9A7	625 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	DACT1	Q9NYF0	836 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	DENND3	A2RUS2	1198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	SEPT4	O43236	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	PPP3CC	P48454	512 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	HLF	Q16534	295 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155		Q6ZTC4	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	BTBD18	B2RXH4	712 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	HSPB6	O14558	160 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	STRN	O43815	780 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	FCGR1A	P12314	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	NAGA	P17050	411 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	MT3	P25713	68 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	NUDT6	P53370	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	MON1B	Q7L1V2	547 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	FJX1	Q86VR8	437 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	CLPB	Q9H078	707 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	MST1R	Q04912	1400 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	HMX3	A6NHT5	357 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	ITM2A	O43736	263 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	DDAH2	O95865	285 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	CHN1	P15882	459 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	GNLY	P22749	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT2-222	ENST00000550155	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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