RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 WBP1LQ9NX94 342 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 VWA8A3KMH1 1905 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 SCN5AQ14524 2016 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 OR6C75A6NL08 312 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 I6L893 689 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 CDH16O75309 829 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 GCATO75600 419 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 IGLV3-25P01717 112 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 FOSL1P15407 271 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 VAV1P15498 845 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 NFKBIAP25963 317 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 MAGEA6P43360 314 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 MMP13P45452 471 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 HCAR3P49019 387 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 SLC11A1P49279 550 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 CXCR3P49682 368 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 TPI1P60174 286 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 PDK1Q15118 436 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 CTXN3Q4LDR2 81 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 MSS51Q4VC12 460 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 SPDYAQ5MJ70 313 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 FAM171A1Q5VUB5 890 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 TAOK1Q7L7X3 1001 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 SPATA24Q86W54 205 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 SCN4BQ8IWT1 228 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 PDIK1LQ8N165 341 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 ESX1Q8N693 406 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 LRRN4Q8WUT4 740 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 HTR3CQ8WXA8 447 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 SCLYQ96I15 445 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 TMEM175Q9BSA9 504 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 TPK1Q9H3S4 243 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 WDCPQ9H6R7 721 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 DCLRE1BQ9H816 532 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 VPS37BQ9H9H4 285 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 ANLNQ9NQW6 1124 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 ABCC13Q9NSE7 274 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 TXLNGQ9NUQ3 528 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 ATAD3AQ9NVI7 634 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 MARCH5Q9NX47 278 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 LGALS13Q9UHV8 139 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 SATB2Q9UPW6 733 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 CLUHO75153 1309 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 TTC3P53804 2025 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 MYO16Q9Y6X6 1858 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 TET1Q8NFU7 2136 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 FAM72CH0Y354 149 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 IRAK2O43187 625 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 BANF1O75531 89 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 UBOX5O94941 541 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 UPP2O95045 317 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 AMHP03971 560 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 TSHRP16473 764 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 ERCC2P18074 760 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 FGFR3P22607 806 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 PHBP35232 272 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 MAGEA11P43364 429 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 CCL23P55773 120 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 GPX6P59796 221 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 FAAP100Q0VG06 881 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 CBLBQ13191 982 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 RCN2Q14257 317 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 BBS9Q3SYG4 887 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 FAM72AQ5TYM5 149 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 BTBD8Q5XKL5 378 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 FAM72DQ6L9T8 149 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 FUT10Q6P4F1 479 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 Q6ZNX1 250 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 LONP2Q86WA8 852 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 FAM72BQ86X60 149 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 TDRPQ86YL5 185 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms