RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533342.5

ANKRD42-209, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 1,949 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-209ENST00000533342 CNTN1Q12860 1018 aa11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 EFHC2Q5JST6 749 aa11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 KCNT1Q5JUK3 1230 aa11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 SPDYCQ5MJ68 293 aa11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 NLRP14Q86W24 1093 aa11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 MINDY1Q8N5J2 469 aa11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 DEFB124Q8NES8 71 aa11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 OR8D1Q8WZ84 308 aa11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 FOXJ1Q92949 421 aa11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 ARHGEF26Q96DR7 871 aa11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 CAMK1GQ96NX5 476 aa11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 MYOCQ99972 504 aa11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 OSBPL2Q9H1P3 480 aa11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 PARVAQ9NVD7 372 aa11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 WDR70Q9NW82 654 aa11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 CAPN11Q9UMQ6 739 aa11.07□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 A0A087X0T9 212 aa11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 ILVBLA1L0T0 632 aa11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 TM4SF5O14894 197 aa11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 ZMPSTE24O75844 475 aa11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 IGHV4-34P06331 123 aa11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 FAM228BP0C875 321 aa11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 EPHB2P29323 1055 aa11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 ZBED6P86452 979 aa11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 GRIK2Q13002 908 aa11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 MTA1Q13330 715 aa11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 C22orf39Q6P5X5 142 aa11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 DCAF4L2Q8NA75 395 aa11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 KDM1BQ8NB78 822 aa11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 ARRDC3Q96B67 414 aa11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 SLC6A18Q96N87 628 aa11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 THAP2Q9H0W7 228 aa11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 CAAP1Q9H8G2 361 aa11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 CA5BQ9Y2D0 317 aa11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 TBC1D3EA0A087X179 549 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 TMEM191CA6NGB0 347 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 TBC1D3LB9A6J9 549 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 ARHGAP33O14559 1287 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 CD160O95971 181 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 TBC1D3HP0C7X1 549 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 RHOQP17081 205 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 SDHBP21912 280 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 LIMK1P53667 647 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 ADPRHP54922 357 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 IL9RQ01113 521 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 ARID5BQ14865 1188 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 SMTNL2Q2TAL5 461 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 ARSIQ5FYB1 569 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 FIGNQ5HY92 759 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 KIAA0895LQ68EN5 471 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 CADM4Q8NFZ8 388 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 OR2A12Q8NGT7 310 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 DNASE2BQ8WZ79 361 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 NTAN1Q96AB6 310 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 HMCESQ96FZ2 354 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 PACSIN1Q9BY11 444 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 EDEM3Q9BZQ6 932 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 FBRSQ9HAH7 460 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 SGK2Q9HBY8 427 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 TM9SF3Q9HD45 589 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 TMEM248Q9NWD8 314 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 AP4E1Q9UPM8 1137 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 HS3ST2Q9Y278 367 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 CACNA1EQ15878 2313 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 A0A1B0GTW7 788 aa11.05□□□□□ -0.64
ANKRD42-209ENST00000533342 A0A1W2PQJ5 194 aa11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms