RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 ACOX1Q15067 660 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 RNF212Q495C1 297 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 DSELQ8IZU8 1212 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 TEX45Q8NA69 505 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC24A4Q8NFF2 622 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR1N1Q8NGS0 311 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 OVCA2Q8WZ82 227 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPSB4Q96A44 273 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 CHRDL1Q9BU40 450 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 TUBB2BQ9BVA1 445 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 HDAC9Q9UKV0 1011 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 MOB4Q9Y3A3 225 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM220BPB1ANY3 271 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 PRR32B1ATL7 298 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 KCNJ18B7U540 433 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 AGPSO00116 658 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 PDE8AO60658 829 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 INMTO95050 263 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 CAVIN2O95810 425 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 TFRCP02786 760 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 ALOX5P09917 674 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF32P17041 273 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 GPTP24298 496 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 RPL3P39023 403 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 PPP3CCP48454 512 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 LIMK2P53671 638 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 ERVK-21P61565 698 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRT85P78386 507 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 MTAPQ13126 283 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 PLS1Q14651 629 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM187Q14656 261 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 UAP1L1Q3KQV9 507 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 PDSS1Q5T2R2 415 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMCO4Q5TGY1 634 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 NCAPH2Q6IBW4 605 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM71Q6P5X7 295 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 DOK6Q6PKX4 331 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 DSG4Q86SJ6 1040 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC9B2Q86UD5 537 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 DDHD1Q8NEL9 900 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR6B3Q8NGW1 331 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF721Q8TF20 911 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 TM9SF4Q92544 642 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC35A4Q96G79 324 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 GPR78Q96P69 363 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 KLHL1Q9NR64 748 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 PAM16Q9Y3D7 125 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 C2CD2Q9Y426 696 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 MRFAP1Q9Y605 127 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 C17orf102A2RUQ5 167 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 RASA4BC9J798 803 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 DVL1O14640 695 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 PI15O43692 258 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 CNTN5O94779 1100 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 LINC00271P0C7V0 271 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 PIK3R1P27986 724 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 ARFIP2P53365 341 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 STRN3Q13033 797 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 GAGE5Q13069 117 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 GAGE6Q13070 117 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 CTBP1Q13363 440 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 ARHGEF7Q14155 803 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 ACAP2Q15057 778 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 OLFML2AQ68BL7 652 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 ACSM6Q6P461 480 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF790Q6PG37 636 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRT77Q7Z794 578 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 MPP5Q8N3R9 675 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF614Q8N883 585 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 LRRC57Q8N9N7 239 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 ALG14Q96F25 216 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 C18orf12Q96KH6 178 aa0.42□□□□□ -2.34
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