RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
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SH3BP2-210ENST00000505941 PRNPP04156 253 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 MIPP30301 263 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
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SH3BP2-210ENST00000505941 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
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SH3BP2-210ENST00000505941 H2AFVQ71UI9 128 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 TMIEQ8NEW7 156 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 OR2A12Q8NGT7 310 aa21.52■■□□□ 1.04
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SH3BP2-210ENST00000505941 TNKS2Q9H2K2 1166 aa21.52■■□□□ 1.04
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