RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502394.1

MATR3-231, Transcript of matrin 3, human

TSL 4

Gene MATR3, Length 589 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-231	ENST00000502394	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	PLK1	P53350	603 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	IL10RB	Q08334	325 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	CUL1	Q13616	776 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	DHCR24	Q15392	516 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	GAB4	Q2WGN9	574 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	MFN1	Q8IWA4	741 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	IFT20	Q8IY31	132 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF567	Q8N184	647 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	TEX26	Q8N6G2	289 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	CNTD1	Q8N815	330 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	12.41	□□□□□ -0.42	8e-9	■■□□□ 12.1
MATR3-231	ENST00000502394	TTC16	Q8NEE8	873 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	DDI1	Q8WTU0	396 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	SNF8	Q96H20	258 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	VAT1	Q99536	393 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	HINFP	Q9BQA5	517 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	DPH5	Q9H2P9	285 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	HPS4	Q9NQG7	708 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	PAK5	Q9P286	719 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394		H0Y626	953 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	KDELR3	O43731	214 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	CD160	O95971	181 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	ARSA	P15289	507 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	ETFB	P38117	255 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	CSK	P41240	450 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	IFNAR2	P48551	515 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	VPS41	P49754	854 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	LMAN2	Q12907	356 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	GPS1	Q13098	491 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	HTR4	Q13639	388 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	PDGFRL	Q15198	375 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	TEX44	Q53QW1	395 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	PARM1	Q6UWI2	310 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	C4orf22	Q6V702	233 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	CPT1B	Q92523	772 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	FGF14	Q92915	247 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	ART4	Q93070	314 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	TEKT5	Q96M29	485 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF599	Q96NL3	588 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	PLK2	Q9NYY3	685 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
MATR3-231	ENST00000502394	ARNTL	O00327	626 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	METTL18	O95568	372 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	JCHAIN	P01591	159 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	CCNB1	P14635	433 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	TYR	P14679	529 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	FOSL2	P15408	326 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	ITIH2	P19823	946 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	KCNA5	P22460	613 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	GLDC	P23378	1020 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	MCM3	P25205	808 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	HLA-F	P30511	346 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	CD70	P32970	193 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	OXCT1	P55809	520 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	ARF5	P84085	180 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	SEMA5A	Q13591	1074 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	SLC12A1	Q13621	1099 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	CDH18	Q13634	790 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	KCNJ11	Q14654	390 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	ANO4	Q32M45	955 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	DEFB123	Q8N688	67 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	12.39	□□□□□ -0.43
MATR3-231	ENST00000502394	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		12.39	□□□□□ -0.43

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