RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	MMRN1	Q13201	1228 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	CCDC6	Q16204	474 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	TEKT4	Q8WW24	435 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	HMCES	Q96FZ2	354 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	FAM129B	Q96TA1	746 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	INTU	Q9ULD6	942 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	PI4KA	P42356	2102 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	WASH4P	A8MWX3	477 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	DFFA	O00273	331 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	KDELR3	O43731	214 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	NDUFS2	O75306	463 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF217	O75362	1048 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	MTA2	O94776	668 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	IL1B	P01584	269 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	CD48	P09326	243 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	HTR7	P34969	479 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	ARHGAP25	P42331	645 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	TPMT	P51580	245 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	CREB5	Q02930	508 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	DPYS	Q14117	519 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	CST6	Q15828	149 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	DPYSL2	Q16555	572 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	PARP15	Q460N3	678 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	KIAA1328	Q86T90	577 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM139	Q8IV31	216 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	NPW	Q8N729	165 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	KCTD6	Q8NC69	237 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	CHST14	Q8NCH0	376 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	RUBCN	Q92622	972 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	OMD	Q99983	421 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	DESI2	Q9BSY9	194 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	GPR174	Q9BXC1	333 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	CALN1	Q9BXU9	219 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	FBRS	Q9HAH7	460 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CALD1-223	ENST00000496024		A0A1W2PP55	124 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	RCCD1	A6NED2	376 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	PLK4	O00444	970 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	SPOP	O43791	374 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	KRT7	P08729	469 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	CD6	P30203	668 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	SLC8A1	P32418	973 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	MAN1A1	P33908	653 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	PTGER3	P43115	390 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	HCAR3	P49019	387 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	NDST2	P52849	883 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	METAP1	P53582	386 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	SLC20A2	Q08357	652 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	SPEM2	Q0P670	501 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	SERINC3	Q13530	473 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	PMS2CL	Q68D20	193 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CALD1-223	ENST00000496024	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81

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