RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 GCNT7Q6ZNI0 430 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 Q6ZVU0 165 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SCML4Q8N228 414 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SLC4A11Q8NBS3 891 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 TAS1R2Q8TE23 839 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 NOX5Q96PH1 765 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CISHQ9NSE2 258 aa6.32□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PADI4Q9UM07 663 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 D6RAR5 112 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 M0QYT0 321 aa6.31□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 ATP9BO43861 1147 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 NOBOXO60393 691 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 FBXO21O94952 628 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PRNPP04156 253 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 TRIM49P0CI25 452 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 TRIM49CP0CI26 452 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 HGFP14210 728 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CCR10P46092 362 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ATP1A2P50993 1020 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 THOP1P52888 689 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PDX1P52945 283 aa6.31□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 RAD23BP54727 409 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 POLE2P56282 527 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 TAS2R38P59533 333 aa6.31□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 E2F4Q16254 413 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 C8orf34Q49A92 452 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SEL1L3Q68CR1 1132 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.31□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SPATA20Q8TB22 786 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 FRS2Q8WU20 508 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 IRGQQ8WZA9 623 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 TMEM159Q96B96 161 aa6.31□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 BTN2A3PQ96KV6 586 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CMKLR1Q99788 373 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 TRIM62Q9BVG3 475 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 BOCQ9BWV1 1114 aa6.31□□□□□ -1.4
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CBX1-205ENST00000495350 GULP1Q9UBP9 304 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 VPS28Q9UK41 221 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 A0A1W2PQ27 194 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 A0A1W2PQ64 194 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 A0A1W2PQC6 194 aa6.3□□□□□ -1.4
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