RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489977.5

SKAP2-206, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 679 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-206ENST00000489977 SLC39A10Q9ULF5 831 aa4.02□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 CNTN6Q9UQ52 1028 aa4.02□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 CEP83Q9Y592 693 aa4.02□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa4.02□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa4.02□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 A0A0A0MQY5 61 aa4.01□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 HSPB6O14558 160 aa4.01□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 KCNJ13O60928 360 aa4.01□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 TMCC1O94876 653 aa4.01□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 TRIM27P14373 513 aa4.01□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 RCAN1P53805 252 aa4.01□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP4.01□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 HLFQ16534 295 aa4.01□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 BTBD16Q32M84 506 aa4.01□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 OR2C3Q8N628 320 aa4.01□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 TMEM163Q8TC26 289 aa4.01□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 ZNF333Q96JL9 665 aa4.01□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 SPRY4Q9C004 299 aa4.01□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 SDF2L1Q9HCN8 221 aa4.01□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 SLC22A11Q9NSA0 550 aa4.01□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 MST1RQ04912 1400 aa4.01□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 LARGE1O95461 756 aa4□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 CGAP01215 116 aa4□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 SP1P08047 785 aa4□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 F7P08709 466 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 MYZAPP0CAP1 466 aa4□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 PRKCHP24723 683 aa4□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 TYK2P29597 1187 aa4□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 KRTAP10-12P60413 245 aa4□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 SLC39A14Q15043 492 aa4□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa4□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 C5orf22Q49AR2 442 aa4□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 SYTL3Q4VX76 610 aa4□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 SLC35F5Q8WV83 523 aa4□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 NODALQ96S42 347 aa4□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 SLC25A33Q9BSK2 321 aa4□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 GAREM1Q9H706 876 aa4□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 DONSONQ9NYP3 566 aa4□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 CDH22Q9UJ99 828 aa4□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 LINC01553A4QN01 128 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 BMPR1BO00238 502 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 ASNA1O43681 348 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 BUB3O43684 328 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 CLDN7O95471 211 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 HLA-DQA2P01906 255 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 FCGR2AP12318 317 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 CDH12P55289 794 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 MON1BQ7L1V2 547 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 RNF144BQ7Z419 303 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 TRIM74Q86UV6 250 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 TRIM73Q86UV7 250 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 TEX45Q8NA69 505 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 MIGA1Q8NAN2 632 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 PJA1Q8NG27 643 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 OR1N1Q8NGS0 311 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 HDAC7Q8WUI4 952 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 HMGB4Q8WW32 186 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 KIAA1191Q96A73 305 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 HES6Q96HZ4 224 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 IGSF21Q96ID5 467 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 FNIP2Q9P278 1114 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 KLHL42Q9P2K6 505 aa3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 PRR23AA6NEV1 266 aa3.98□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 CDK18Q07002 472 aa3.98□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 MYBPC2Q14324 1141 aa3.98□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 LONRF1Q17RB8 773 aa3.98□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 ZACNQ401N2 412 aa3.98□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa3.98□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 FRG2BQ96QU4 278 aa3.98□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 CERS4Q9HA82 394 aa3.98□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 PDE11AQ9HCR9 933 aa3.98□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 SEL1LQ9UBV2 794 aa3.98□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.98□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 WDR81Q562E7 1941 aa3.97□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 NPIPB13A6NJU9 1138 aa3.97□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 AQP12BA6NM10 295 aa3.97□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 NPIPB5A8MRT5 1133 aa3.97□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 NPIPB4C9JG80 1138 aa3.97□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 GRM8O00222 908 aa3.97□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 DAOP14920 347 aa3.97□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 OAZ1P54368 228 aa3.97□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP3.97□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 RETSATQ6NUM9 610 aa3.97□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 ZNF449Q6P9G9 518 aa3.97□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 VPS52Q8N1B4 723 aa3.97□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 PARD3BQ8TEW8 1205 aa3.97□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 C2CD4CQ8TF44 421 aa3.97□□□□□ -1.77
SKAP2-206ENST00000489977 STYXQ8WUJ0 223 aa3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms