RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489853.1

SNRNP40-206, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 1,928 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-206	ENST00000489853	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	ZNF786	Q8N393	782 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	PARP8	Q8N3A8	854 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	UBR7	Q8N806	425 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	ANKFN1	Q8N957	763 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	NRBF2	Q96F24	287 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	SLC29A1	Q99808	456 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	SPON2	Q9BUD6	331 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	CD320	Q9NPF0	282 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	COPG2	Q9UBF2	871 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	FAM170A	A1A519	330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	OR5K3	A6NET4	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	TSPY2	A6NKD2	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	GPR25	O00155	361 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	ACOT8	O14734	319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	SLC22A2	O15244	555 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	ZW10	O43264	779 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	PSTPIP1	O43586	416 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	NMT2	O60551	498 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	KRT37	O76014	449 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	TSPY3	P0CV98	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	TSPY8	P0CW00	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	RALB	P11234	206 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	BMP2	P12643	396 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	GLUL	P15104	373 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	PROZ	P22891	400 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	CRHR1	P34998	444 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	PTGS2	P35354	604 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	RAD23A	P54725	363 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	MLLT10	P55197	1068 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	KCNQ4	P56696	695 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	MS4A2	Q01362	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	TSPY1	Q01534	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	IFITM3	Q01628	133 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	RALGDS	Q12967	914 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	KLF10	Q13118	480 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	NME3	Q13232	169 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	PPIL2	Q13356	520 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	CDK10	Q15131	360 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	GPR162	Q16538	588 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	PDIK1L	Q8N165	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	DCLK2	Q8N568	766 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	TOP1MT	Q969P6	601 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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