RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486016.1

GCFC2-209, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 3

Gene GCFC2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-209	ENST00000486016	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	TRIM73	Q86UV7	250 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	HMGB4	Q8WW32	186 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF333	Q96JL9	665 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	FRG2B	Q96QU4	278 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016		A0A0A0MQY5	61 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	KRT36	O76013	467 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	TMCC1	O94876	653 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	HLA-DQA2	P01906	255 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	UMOD	P07911	640 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	CYP21A2	P08686	494 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	AK2	P54819	239 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	TUBA1B	P68363	451 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	MUL1	Q969V5	352 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GCFC2-209	ENST00000486016	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	GRM8	O00222	908 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	ASAP2	O43150	1006 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	CLDN7	O95471	211 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	NAGA	P17050	411 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	ABCB4	P21439	1286 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	CDK18	Q07002	472 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	FJX1	Q86VR8	437 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	EID2B	Q96D98	161 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	DUX5	Q96PT3	197 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	GAREM1	Q9H706	876 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016		A0A0B4J293	547 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	KCNJ13	O60928	360 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	DDAH2	O95865	285 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	OAZ1	P54368	228 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	CDH12	P55289	794 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	ZACN	Q401N2	412 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	DAPP1	Q9UN19	280 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	FCGR2A	P12318	317 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	GYS1	P13807	737 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	PNLIPRP1	P54315	467 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	HILS1	P60008	231 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	HLF	Q16534	295 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	TTC22	Q5TAA0	569 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GCFC2-209	ENST00000486016	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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