RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474409.1

CNN3-205, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CNN3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-205ENST00000474409 DUSP12Q9UNI6 340 aa8.51□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.51□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 COL6A3P12111 3177 aa8.51□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 TRPM6Q9BX84 2022 aa8.51□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 J3KR12 359 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 RNF103O00237 685 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 TRIM24O15164 1050 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 TTI1O43156 1089 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 RAD51CO43502 376 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 MAFKO60675 156 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 KRT14P02533 472 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 ASLP04424 464 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 CCNB1P14635 433 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 PTPN3P26045 913 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 MMP13P45452 471 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 VPS41P49754 854 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 RENBPP51606 427 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 PLK1P53350 603 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 ARF5P84085 180 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 P3H1Q32P28 736 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 MARC1Q5VT66 337 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 LINGO4Q6UY18 593 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 LEKR1Q6ZMV7 388 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 TPRG1Q6ZUI0 275 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 MAATS1Q7Z4T9 603 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 JAMLQ86YT9 394 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 MMGT1Q8N4V1 131 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 FAM71DQ8N9W8 422 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 MSANTD3Q96H12 275 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 ZNF599Q96NL3 588 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 TSGA13Q96PP4 275 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 ASB2Q96Q27 587 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 VAT1Q99536 393 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 P2RY13Q9BPV8 354 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 TRIM51Q9BSJ1 452 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 PDFQ9HBH1 243 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 PCDH9Q9HC56 1237 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 TRPV5Q9NQA5 729 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 HEBP1Q9NRV9 189 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 ASIC3Q9UHC3 531 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 RSPH14Q9UHP6 348 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 FBXO10Q9UK96 956 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 SORCS3Q9UPU3 1222 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 OR51B4Q9Y5P0 310 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 KMT2EQ8IZD2 1858 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 SPAG17Q6Q759 2223 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 A0A0A0MRY4 1105 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 TBC1D3BA6NDS4 549 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 FAM187AA6NFU0 413 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 EFCAB8A8MWE9 144 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 MATN3O15232 486 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 OPHN1O60890 802 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 TMCC1O94876 653 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 KAT7O95251 611 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 JCHAINP01591 159 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 HLA-DQB2P05538 268 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 CISD3P0C7P0 127 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 NNMTP40261 264 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 STK19P49842 368 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 RHOAP61586 193 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 ST8SIA6P61647 398 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 ECT2LQ008S8 904 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 ITKQ08881 620 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 ZBTB17Q13105 803 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 PTK6Q13882 451 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 PON2Q15165 354 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 ADIPOR2Q86V24 386 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-205ENST00000474409 ATP11CQ8NB49 1132 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms