RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 USP30Q70CQ3 517 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM248Q9NWD8 314 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 PCSK1NQ9UHG2 260 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 SCML1Q9UN30 329 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A1B0GTW7 788 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 ADH1BP00325 375 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 IGHV4-34P06331 123 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 GZMAP12544 262 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 GOT1P17174 413 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 VASPP50552 380 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 ZBED6P86452 979 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 BNC1Q01954 994 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 SCAPQ12770 1279 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 CA9Q16790 459 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 KIAA0895LQ68EN5 471 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 C22orf39Q6P5X5 142 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 MINDY1Q8N5J2 469 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 NETO2Q8NC67 525 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 OR14C36Q8NHC7 312 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 C1orf216Q8TAB5 229 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 PEBP4Q96S96 227 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 SUSD2Q9UGT4 822 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM191CA6NGB0 347 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 C5AR1P21730 350 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 DNA2P51530 1060 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 GRIK2Q13002 908 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 RABEPKQ7Z6M1 372 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 OR2A12Q8NGT7 310 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 EBF2Q9HAK2 575 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 NCOR2Q9Y618 2525 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A1B0GVT2 93 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 MCF2LO15068 1137 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 KCNK5O95279 499 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 CD160O95971 181 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 SERPING1P05155 500 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 EPHB2P29323 1055 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 L1CAMP32004 1257 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 MAPKAPK2P49137 400 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 CNTN1Q12860 1018 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF783Q6ZMS7 281 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 ORAI3Q9BRQ5 295 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 KLC2Q9H0B6 622 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 ISCUQ9H1K1 167 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 TM9SF3Q9HD45 589 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 PPM1HQ9ULR3 514 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 PLXNA2O75051 1894 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A087X0T9 212 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM228BP0C875 321 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 CHRNA3P32297 505 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 ADPRHP54922 357 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 PPP2CBP62714 309 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 PPP2CAP67775 309 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF354CQ86Y25 554 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 DEFB124Q8NES8 71 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 ARRDC3Q96B67 414 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 PCED1AQ9H1Q7 454 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 IL21RQ9HBE5 538 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 FZD4Q9ULV1 537 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 AP4E1Q9UPM8 1137 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 SYPP08247 313 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 SEMA3BQ13214 749 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 ARSIQ5FYB1 569 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 RETSATQ6NUM9 610 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 DSG4Q86SJ6 1040 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 OR2T34Q8NGX1 318 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 BTBD6Q96KE9 485 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC6A18Q96N87 628 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 EPAS1Q99814 870 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 TM6SF2Q9BZW4 377 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 THAP2Q9H0W7 228 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa24.39■■□□□ 1.49
SH3BP5-208ENST00000459627 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa24.39■■□□□ 1.49
SH3BP5-208ENST00000459627 TBC1D3EA0A087X179 549 aa24.39■■□□□ 1.49
SH3BP5-208ENST00000459627 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa24.39■■□□□ 1.49
SH3BP5-208ENST00000459627 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms