RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456049.1

VSTM2A-OT1-201, VSTM2A overlapping transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSTM2A-OT1, Length 3,031 nt, Biotype sense overlapping.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 CEBPBP17676 345 aa3.12□□□□□ -1.91
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VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 TJAP1Q5JTD0 557 aa3.12□□□□□ -1.91
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