RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442928.6

TRAF3IP2-AS1-205, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 LRRC40Q9H9A6 602 aa10.45□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TRPV4Q9HBA0 871 aa10.45□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 SAYSD1Q9NPB0 183 aa10.45□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 OGFRQ9NZT2 677 aa10.45□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PLAAQ9Y263 795 aa10.45□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 NFS1Q9Y697 457 aa10.45□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CUL9Q8IWT3 2517 aa10.45□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 MAGEB16A2A368 324 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 GOLGA6L10A6NI86 522 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 J3KR12 359 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TSPAN3O60637 253 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 FSHRP23945 695 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PSMB4P28070 264 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 MMP13P45452 471 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 NPY2RP49146 381 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PLK1P53350 603 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 NTHL1P78549 312 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 SLC20A2Q08357 652 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 IFFO1Q0D2I5 559 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 HYAL1Q12794 435 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 MPP3Q13368 585 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ADAM15Q13444 863 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CDH18Q13634 790 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 SLC29A2Q14542 456 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 LBRQ14739 615 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 STAT4Q14765 748 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 FNBP1LQ5T0N5 605 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 IL31Q6EBC2 164 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TMC5Q6UXY8 1006 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CYS1Q717R9 158 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ZNF354CQ86Y25 554 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ZBED8Q8IZ13 594 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ATP11CQ8NB49 1132 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 NETO2Q8NC67 525 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ACDQ96AP0 544 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 SLC2A11Q9BYW1 496 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 EPB41L4BQ9H329 900 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PDFQ9HBH1 243 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ATP13A1Q9HD20 1204 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 NINJ2Q9NZG7 142 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 MARK1Q9P0L2 795 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 FETUBQ9UGM5 382 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 SEPT3Q9UH03 358 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CHD9Q3L8U1 2897 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 GBF1Q92538 1859 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 SDR42E2A6NKP2 422 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 GOLGA8KD6RF30 607 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 GOLGA8MH3BSY2 632 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 AGPSO00116 658 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PENKP01210 267 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 IVLP07476 585 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CEBPBP17676 345 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 NFKB1P19838 968 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ACVRL1P37023 503 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 SGSHP51688 502 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 DMC1Q14565 340 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 KYNUQ16719 465 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 BBS9Q3SYG4 887 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TCEAL5Q5H9L2 206 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 RALGPS1Q5JS13 557 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ATAT1Q5SQI0 421 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 FAXCQ5TGI0 409 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ALG1LQ6GMV1 187 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CES5AQ6NT32 575 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 RETSATQ6NUM9 610 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 MFN1Q8IWA4 741 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PALM2Q8IXS6 379 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 KRT222Q8N1A0 295 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CARNMT1Q8N4J0 409 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 DCAF4L2Q8NA75 395 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ITFG1Q8TB96 612 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 SMARCD2Q92925 531 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 IRF7Q92985 503 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ZSWIM3Q96MP5 696 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PSKH2Q96QS6 385 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 FEM1AQ9BSK4 669 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 SPON2Q9BUD6 331 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 MUC3BQ9H195 1237 aa10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms