RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
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PRAME-210ENST00000442481 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
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PRAME-210ENST00000442481 IGLV3-27P01718 113 aa12□□□□□ -0.49
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PRAME-210ENST00000442481 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
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PRAME-210ENST00000442481 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
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PRAME-210ENST00000442481 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 TRIM14Q14142 442 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 MS4A13Q5J8X5 152 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa11.98□□□□□ -0.49
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