RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 SELENOOQ9BVL4 669 aa20.03■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 ATP13A1Q9HD20 1204 aa20.03■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 ADAM22Q9P0K1 906 aa20.03■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 DFNA5O60443 496 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 WNT1P04628 370 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 KRT3P12035 628 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 GLDCP23378 1020 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 CHRNA3P32297 505 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 GRK6P43250 576 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 DNA2P51530 1060 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 INAVAQ3KP66 663 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 CCDC14Q49A88 953 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 RAB6CQ53S08 254 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 CCDC157Q569K6 752 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 BNIPLQ7Z465 357 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 AOPEPQ8N6M6 819 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 JOSD2Q8TAC2 188 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 RAB6CQ9H0N0 254 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 TNKS2Q9H2K2 1166 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 KDM4CQ9H3R0 1056 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 GDF3Q9NR23 364 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 OR12D3Q9UGF7 316 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa20.02■□□□□ 0.8
NPAS1-201ENST00000439365 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa20.02■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 SPEGQ15772 3267 aa20.02■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 ILVBLA1L0T0 632 aa20.02■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 WNT9AO14904 365 aa20.02■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 CLCN6P51797 869 aa20.02■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 CCDC15Q0P6D6 951 aa20.02■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 AGBL4Q5VU57 503 aa20.02■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 RETSATQ6NUM9 610 aa20.02■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 DBX2Q6ZNG2 339 aa20.02■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 GLRX5Q86SX6 157 aa20.02■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 SLCO6A1Q86UG4 719 aa20.02■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 OR2A12Q8NGT7 310 aa20.02■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.02■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM8BA6NDV4 472 aa20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 C2CD4BA6NLJ0 364 aa20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 PCDHGA12O60330 932 aa20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 PRNPP04156 253 aa20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 CALB1P05937 261 aa20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 CTSLP07711 333 aa20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 UNGP13051 313 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 ADRA1BP35368 520 aa20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 GNA12Q03113 381 aa20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 STAT4Q14765 748 aa20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 C22orf39Q6P5X5 142 aa20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 GATAD2AQ86YP4 633 aa20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 FAM172AQ8WUF8 416 aa20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 IL36AQ9UHA7 158 aa20.01■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 ZFHX4Q86UP3 3567 aa20■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 PLXNA2O75051 1894 aa20■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 A0A1B0GTQ1 180 aa20■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 A0A1W2PR77 199 aa20■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 TLR4O00206 839 aa20■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 LATO43561 262 aa20■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 ITGAVP06756 1048 aa20■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 PTPN9P43378 593 aa20■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 TYRO3Q06418 890 aa20■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 ARSIQ5FYB1 569 aa20■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 CHST14Q8NCH0 376 aa20■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 TMIEQ8NEW7 156 aa20■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 ERGIC2Q96RQ1 377 aa20■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 AGPAT1Q99943 283 aa20■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 PREBQ9HCU5 417 aa20■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 FTSJ1Q9UET6 329 aa20■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 DNAI1Q9UI46 699 aa20■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 USP24Q9UPU5 2620 aa19.99■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 ANKRD62A6NC57 917 aa19.99■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 LRRC10BA6NIK2 292 aa19.99■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 TNFSF14O43557 240 aa19.99■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 ATP1A3P13637 1013 aa19.99■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 GPD1P21695 349 aa19.99■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 NUDT1P36639 197 aa19.99■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 DNAJC24Q6P3W2 148 aa19.99■□□□□ 0.79
NPAS1-201ENST00000439365 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms