RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DPP3Q9NY33 737 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GGA2Q9UJY4 613 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A1W2PQU0 124 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GLB1P16278 677 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TSHRP16473 764 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAN1A1P33908 653 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLA2G4AP47712 749 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VAMP7P51809 220 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DSG2Q14126 1118 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BMPERQ8N8U9 685 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 INPP5DQ92835 1189 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NUDT9Q9BW91 350 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FGF21Q9NSA1 209 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABCB8Q9NUT2 735 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OCIAD1Q9NX40 245 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C2CD2Q9Y426 696 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PIPSLA2A3N6 862 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPINT1O43278 529 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IL1BP01584 269 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PBX1P40424 430 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 METAP1P53582 386 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PEX3P56589 373 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM200AQ86VY9 491 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HORMAD1Q86X24 394 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FDCSPQ8NFU4 85 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCDH19Q8TAB3 1148 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IL25Q9H293 177 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RDH14Q9HBH5 336 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COMMD8Q9NX08 183 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRPM6Q9BX84 2022 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POM121BA6NF01 834 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 M0R2N6 131 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PGFP49763 221 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TAS2R38P59533 333 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TPRG1LQ5T0D9 272 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CERCAMQ5T4B2 595 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KLHDC10Q6PID8 442 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CEACAM20Q6UY09 585 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ULK2Q8IYT8 1036 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STK40Q8N2I9 435 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPR156Q8NFN8 814 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SCAMP5Q8TAC9 235 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM212AQ96EL1 285 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MRGPRX3Q96LB0 322 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C5AR2Q9P296 337 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STK17AQ9UEE5 414 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZANQ9Y493 2812 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ITIH6Q6UXX5 1313 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGEF35A5YM69 484 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KATNA1O75449 491 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLDN14O95500 239 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IFNA2P01563 188 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDC27P30260 824 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GLRBP48167 497 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LIMK2P53671 638 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 B4GALNT1Q00973 533 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EDRF1Q3B7T1 1238 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM217AQ8IXS0 508 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UBR7Q8N806 425 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SIMC1Q8NDZ2 872 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MBD6Q96DN6 1003 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ASB7Q9H672 318 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDE7BQ9NP56 450 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GDAP2Q9NXN4 497 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARGFXA6NJG6 315 aa8.77□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZBTB43O43298 467 aa8.77□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BAG4O95429 457 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.77□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DNASE1P24855 282 aa8.77□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CNTN1Q12860 1018 aa8.77□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC47A2Q86VL8 602 aa8.77□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SEC14L1Q92503 715 aa8.77□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TTC17Q96AE7 1141 aa8.77□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COX4I2Q96KJ9 171 aa8.77□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms