RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC7A4O43246 635 aa16.6■□□□□ 0.25
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 FTLP02792 175 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa16.6■□□□□ 0.25
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa16.6■□□□□ 0.25
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 MT-CO1P00395 513 aa16.59■□□□□ 0.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MYBL1P10243 752 aa16.59■□□□□ 0.25
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 CHRNA3P32297 505 aa16.59■□□□□ 0.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GRIA4P48058 902 aa16.59■□□□□ 0.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 C21orf59P57076 290 aa16.59■□□□□ 0.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC14A1Q13336 389 aa16.59■□□□□ 0.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MAMLD1Q13495 774 aa16.59■□□□□ 0.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC45A4Q5BKX6 768 aa16.59■□□□□ 0.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa16.59■□□□□ 0.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MANEALQ5VSG8 457 aa16.59■□□□□ 0.25
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 TNKS2Q9H2K2 1166 aa16.59■□□□□ 0.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KDM4CQ9H3R0 1056 aa16.59■□□□□ 0.25
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 FZD10Q9ULW2 581 aa16.59■□□□□ 0.25
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CBFA2T2O43439 604 aa16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SERPING1P05155 500 aa16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCR5P51681 352 aa16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TPI1P60174 286 aa16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZBED6P86452 979 aa16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SEMA3BQ13214 749 aa16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NFKBIBQ15653 356 aa16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM72DQ6L9T8 149 aa16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM72BQ86X60 149 aa16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR2A12Q8NGT7 310 aa16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NCAPGQ9BPX3 1015 aa16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GAREM1Q9H706 876 aa16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF212Q9UDV6 495 aa16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IL36AQ9UHA7 158 aa16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AP4E1Q9UPM8 1137 aa16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa16.58■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa16.57■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A0A1W2PPC4 97 aa16.57■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DAPK3O43293 454 aa16.57■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRPSAP2O60256 369 aa16.57■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGHV4-34P06331 123 aa16.57■□□□□ 0.24
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