RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GMIPQ9P107 970 aa19.04■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 E2F8A0AVK6 867 aa19.04■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TIMM44O43615 452 aa19.04■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HLA-DQB2P05538 268 aa19.04■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCG1P45844 678 aa19.04■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AQP5P55064 265 aa19.04■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT72Q14CN4 511 aa19.04■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC8DQ7L1W4 858 aa19.04■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CEP57Q86XR8 500 aa19.04■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGAP18Q8N392 663 aa19.04■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATAD1Q8NBU5 361 aa19.04■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TLE6Q9H808 572 aa19.04■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF358Q9NW07 568 aa19.04■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COPG2Q9UBF2 871 aa19.04■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYLKQ15746 1914 aa19.03■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WASH4PA8MWX3 477 aa19.03■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GOLGA8TH3BQL2 631 aa19.03■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITM2AO43736 263 aa19.03■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC2A3P11169 496 aa19.03■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COL6A1P12109 1028 aa19.03■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBX4P57082 545 aa19.03■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC153Q494R4 210 aa19.03■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM171A1Q5VUB5 890 aa19.03■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDPK2PQ6A1A2 396 aa19.03■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LONP2Q86WA8 852 aa19.03■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC49Q8IUZ0 686 aa19.03■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C10orf107Q8IVU9 208 aa19.03■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PXYLP1Q8TE99 480 aa19.03■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NSL1Q96IY1 281 aa19.03■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VPS39Q96JC1 886 aa19.03■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FICDQ9BVA6 458 aa19.03■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAB39LQ9H9S4 337 aa19.03■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP19.03■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL37Q9NZH6 218 aa19.03■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FNIP2Q9P278 1114 aa19.03■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DOCK4Q8N1I0 1966 aa19.02■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC78A2IDD5 438 aa19.02■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC22O60826 627 aa19.02■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERPINE1P05121 402 aa19.02■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MPOP05164 745 aa19.02■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC1A6P48664 564 aa19.02■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GEMP55040 296 aa19.02■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCID2Q5JVF3 399 aa19.02■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DENND5AQ6IQ26 1287 aa19.02■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR152Q8TDT2 470 aa19.02■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa19.02■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MIPEPQ99797 713 aa19.02■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A096LPK6 155 aa19.02■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CALB2P22676 271 aa19.02■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADRA1AP35348 466 aa19.02■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POU6F1Q14863 301 aa19.02■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 E2F5Q15329 346 aa19.02■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DLG2Q15700 870 aa19.02■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF280DQ6N043 979 aa19.02■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PKN3Q6P5Z2 889 aa19.02■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLEC14AQ86T13 490 aa19.02■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF683Q8IZ20 524 aa19.02■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABI1Q8IZP0 508 aa19.02■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM13CQ8NE31 585 aa19.02■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 B3GALT6Q96L58 329 aa19.02■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR62Q9BZJ7 368 aa19.02■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa19.02■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARMCX1Q9P291 453 aa19.02■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM92AA1XBS5 289 aa19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARVCFO00192 962 aa19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WFS1O76024 890 aa19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INHAP05111 366 aa19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EZRP15311 586 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SELPP16109 830 aa19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRK2P25098 689 aa19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EFEMP1Q12805 493 aa19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MS4A13Q5J8X5 152 aa19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACVR1CQ8NER5 493 aa19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIKE1Q9BRV8 207 aa19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR6C75A6NL08 312 aa19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NBNO60934 754 aa19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SOAT2O75908 522 aa19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IRF9Q00978 393 aa19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANO4Q32M45 955 aa19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAPNS2Q96L46 248 aa19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BTBD10Q9BSF8 475 aa19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FSD1LQ9BXM9 530 aa19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MCM8Q9UJA3 840 aa19.01■□□□□ 0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms