RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPL22P35268 128 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa17.28■□□□□ 0.36
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRAMD4Q6IC98 578 aa17.28■□□□□ 0.36
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TEX26Q8N6G2 289 aa17.28■□□□□ 0.36
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa17.28■□□□□ 0.36
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TEKT5Q96M29 485 aa17.28■□□□□ 0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
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TOP3BP1-201ENST00000420768 C12orf40Q86WS4 652 aa17.27■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF567Q8N184 647 aa17.27■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC110Q8TBZ0 833 aa17.27■□□□□ 0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 NUDT18Q6ZVK8 323 aa17.26■□□□□ 0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 BBOF1Q8ND07 529 aa17.26■□□□□ 0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TTC17Q96AE7 1141 aa17.26■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNF8Q96H20 258 aa17.26■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa17.26■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 PNKPQ96T60 521 aa17.26■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa17.26■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 EPB41L5Q9HCM4 733 aa17.26■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM114A2Q9NRY5 505 aa17.26■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP17.26■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP17.26■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 SEPT3Q9UH03 358 aa17.26■□□□□ 0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 ITIH2P19823 946 aa17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 IVDP26440 423 aa17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 FDFT1P37268 417 aa17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 OPRD1P41143 372 aa17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 VPS41P49754 854 aa17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF235Q14590 738 aa17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 GEN1Q17RS7 908 aa17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 MBLAC2Q68D91 279 aa17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCGF5Q86SE9 256 aa17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 CNTD1Q8N815 330 aa17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 TTC8Q8TAM2 541 aa17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 AGAP3Q96P47 875 aa17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSKH2Q96QS6 385 aa17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 CEP41Q9BYV8 373 aa17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM129AQ9BZQ8 928 aa17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM31Q9BZY9 425 aa17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 GBA3Q9H227 469 aa17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRDM6Q9NQX0 595 aa17.25■□□□□ 0.35
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