RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414154.6

SMIM19-201, Transcript of small integral membrane protein 19, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM19, Length 793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19-201ENST00000414154 LRRC72A6NJI9 287 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 SIGLEC16A6NMB1 481 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 H0Y8X5 98 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 SDC4P31431 198 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 CTSKP43235 329 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 NSFP46459 744 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 CCR5P51681 352 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 KRT83P78385 493 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 IQCB1Q15051 598 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 AGBL4Q5VU57 503 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 SLCO6A1Q86UG4 719 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 NLRP14Q86W24 1093 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 DRC7Q8IY82 874 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 PYROXD2Q8N2H3 581 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 PNPLA1Q8N8W4 532 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 FAM172AQ8WUF8 416 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 ARRDC3Q96B67 414 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 SPON2Q9BUD6 331 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 ZYG11BQ9C0D3 744 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 OSBPL2Q9H1P3 480 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 TNKS2Q9H2K2 1166 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM19-201ENST00000414154 CHD5Q8TDI0 1954 aa20.08■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 TBC1D3EA0A087X179 549 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 TBC1D3LB9A6J9 549 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 KRT37O76014 449 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 CER1O95813 267 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 TBC1D3HP0C7X1 549 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 C1QTNF9P0C862 333 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 ZNF883P0CG24 379 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 RACK1P63244 317 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 ARF5P84085 180 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 C6orf118Q5T5N4 469 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 IL27RAQ6UWB1 636 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 STRADAQ7RTN6 431 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 DCAF4L2Q8NA75 395 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 VOPP1Q96AW1 172 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 KLK13Q9UKR3 277 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 ASPMQ8IZT6 3477 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 CEP295Q9C0D2 2601 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 CBX4O00257 560 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 VILLO15195 856 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 LATO43561 262 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 LRIG2O94898 1065 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 GPD1P21695 349 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 CHRNA3P32297 505 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 IL9RQ01113 521 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 OGDHQ02218 1023 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 GNA12Q03113 381 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 SHBQ15464 509 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 TEAD4Q15561 434 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 ZNF423Q2M1K9 1284 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 ACAD10Q6JQN1 1059 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 MCOLN2Q8IZK6 566 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 C3orf20Q8ND61 904 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 SELENOOQ9BVL4 669 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 TMEM51Q9NW97 253 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 DNAI1Q9UI46 699 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 ALOX15BO15296 676 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 CCP110O43303 1012 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 ARSIQ5FYB1 569 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 C22orf39Q6P5X5 142 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 CAAP1Q9H8G2 361 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 ATP13A1Q9HD20 1204 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 TOR4AQ9NXH8 423 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 CA5BQ9Y2D0 317 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 CALB1P05937 261 aa20.04■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 FERP16591 822 aa20.04■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 ZNF165P49910 485 aa20.04■□□□□ 0.8
SMIM19-201ENST00000414154 FAM46CQ5VWP2 391 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms