RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPC5P78333 572 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNFAIP1Q13829 316 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 MLC1Q15049 377 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 LY6KQ17RY6 165 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 AGBL2Q5U5Z8 902 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF691Q5VV52 312 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 LSMEM2Q8N112 164 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 POC5Q8NA72 575 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 MIGA1Q8NAN2 632 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 KDM1BQ8NB78 822 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRAPQ8TCY5 172 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRGPRDQ8TDS7 321 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 SEMA4DQ92854 862 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 MKL1Q969V6 931 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 GAL3ST4Q96RP7 486 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIP5K1AQ99755 562 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 SYT15Q9BQS2 421 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 C1orf43Q9BWL3 253 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 TANGO6Q9C0B7 1094 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLEKHA3Q9HB20 300 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRS2Q9HD23 443 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF146Q9NTX7 359 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 RLIMQ9NVW2 624 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL17CQ9P0M4 197 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCOCQ9UIL1 159 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNX14Q9Y5W7 946 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 EMSYQ7Z589 1322 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 COL6A6A6NMZ7 2263 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A0G2JPF8 293 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 DYTNA2CJ06 578 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 PINLYPA6NC86 204 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRSS29PA6NIE9 313 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 A8MZ25 164 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF878C9JN71 531 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF587BE7ETH6 402 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 SOCS3O14543 225 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 GAGE7O76087 117 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 SGPL1O95470 568 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 HPRP00739 348 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 GAGE12FP0CL80 117 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 GAGE12GP0CL81 117 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 GAGE12IP0CL82 117 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 AKR1A1P14550 325 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD72P21854 359 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADORA2AP29274 412 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 THPOP40225 353 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPOXP50336 477 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 WDR5P61964 334 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF33BQ06732 778 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYO1EQ12965 1108 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 GAGE1Q13065 139 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 GAGE4Q13068 117 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 PGS1Q32NB8 556 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNNI3KQ59H18 835 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 WDR38Q5JTN6 314 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATAT1Q5SQI0 421 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM47BQ8NA70 645 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL31RAQ8NI17 732 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 SIPA1Q96FS4 1042 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC1Q9BTT6 524 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 PINK1Q9BXM7 581 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLHL31Q9H511 634 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 GREM2Q9H772 168 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 GNB4Q9HAV0 340 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPR35Q9HC97 309 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 NECAP2Q9NVZ3 263 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBXO40Q9UH90 709 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 SIX4Q9UIU6 781 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 RIMKLBQ9ULI2 386 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM168BA1KXE4 195 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF233A6NK53 670 aa-0.84□□□□□ -2.54
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