RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 AP3M1Q9Y2T2 418 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 GJB1P08034 283 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 ALDH9A1P49189 494 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 XRCC4Q13426 336 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 DGKZQ13574 1117 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 STXBP5Q5T5C0 1151 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 C11orf74Q86VG3 221 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 SNX32Q86XE0 403 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 PBX1P40424 430 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 HSDL1Q3SXM5 330 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 BRMS1LQ5PSV4 323 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM199Q8N511 208 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 RNPEPQ9H4A4 650 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 ARMC7Q9H6L4 198 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 ASAH2Q9NR71 780 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM50BQ9Y247 325 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 A0A0U1RQJ8 604 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 GOT1P17174 413 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 TUSC3Q13454 348 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 CRYMQ14894 314 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 CYP2A13Q16696 494 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 C16orf46Q6P387 395 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 NKX2-3Q8TAU0 364 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 USE1Q9NZ43 259 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 YDJCA8MPS7 323 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 NUDT17P0C025 328 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 KRT20P35900 424 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 GPR15P49685 360 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 ACSM2AQ08AH3 577 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 ACSM2BQ68CK6 577 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 NECAB2Q7Z6G3 386 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM191CA6NGB0 347 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 ATP6V1G2O95670 118 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 GSTM1P09488 218 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 RXRGP48443 463 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 IRF2BP1Q8IU81 584 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 POU5F2Q8N7G0 328 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 ENO4A6NNW6 628 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 INPP4BO15327 924 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 MTA2O94776 668 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 ANXA5P08758 320 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 TTPAP49638 278 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 ANKRD23Q86SG2 305 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 FIG4Q92562 907 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 LDLRP01130 860 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 S100A3P33764 101 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 NAGLUP54802 743 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC34A1Q06495 639 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 PAGE2BQ5JRK9 111 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 ATAD3BQ5T9A4 648 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 C9orf57Q5W0N0 161 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 STRADAQ7RTN6 431 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 MON1AQ86VX9 555 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 C12orf29Q8N999 325 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 TERB1Q8NA31 727 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 RSPH1Q8WYR4 309 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 HIC2Q96JB3 615 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 SEMA3CQ99985 751 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 ACSS3Q9H6R3 686 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 ASB8Q9H765 288 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC167Q9P0B6 97 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 RABGEF1Q9UJ41 708 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 LBPP18428 481 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 PPM1AP35813 382 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 TAS2R40P59535 323 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 AFTPHQ6ULP2 937 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 SEPHS2Q99611 448 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 UGT2B28Q9BY64 529 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 MYLK2Q9H1R3 596 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 CXorf56Q9H5V9 222 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 PIF1Q9H611 641 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM220BPB1ANY3 271 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 KPNA5O15131 536 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 MMP8P22894 467 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 CES1P23141 567 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 SPPL2AQ8TCT8 520 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 SEMA4DQ92854 862 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 KREMEN1Q96MU8 473 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 MAN1C1Q9NR34 630 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-203ENST00000409212 ZMYM5Q9UJ78 669 aa16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms