RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381196.8

PTPRD-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 9,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-203ENST00000381196 CDH4P55283 916 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 SELPLGQ14242 412 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 TOMM20Q15388 145 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 TRAM1Q15629 374 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 ZFP69Q49AA0 526 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 DEPDC1Q5TB30 811 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 HHIPL2Q6UWX4 724 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 PAMR1Q6UXH9 720 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 TRIM48Q8IWZ4 208 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 IQCF2Q8IXL9 164 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 S100A14Q9HCY8 104 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 ILVBLA1L0T0 632 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRD-203ENST00000381196 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRD-203ENST00000381196 SZRD1Q7Z422 152 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 KDM1BQ8NB78 822 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 TRAPPC13A5PLN9 417 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRD-203ENST00000381196 ANXA9O76027 345 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 CYP2D6P10635 497 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRD-203ENST00000381196 BST2Q10589 180 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
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PTPRD-203ENST00000381196 SLC29A2Q14542 456 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRD-203ENST00000381196 DEFB128Q7Z7B8 93 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 DHRSXQ8N5I4 330 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRD-203ENST00000381196 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
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PTPRD-203ENST00000381196 SLC39A1Q9NY26 324 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 A6NHS1 94 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRD-203ENST00000381196 PDHBP11177 359 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRD-203ENST00000381196 ANAPC7Q9UJX3 599 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 TMEM59LQ9UK28 342 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 TRHDEQ9UKU6 1024 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 M0QYV0 167 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 WWP2O00308 870 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 RGS5O15539 181 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 ZNF23P17027 643 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 SDC4P31431 198 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 PSMC6P62333 389 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 TAS2R42Q7RTR8 314 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 TMC7Q7Z402 723 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 CLNKQ7Z7G1 428 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 NATD1Q8N6N6 113 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRD-203ENST00000381196 BTF3L4Q96K17 158 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRD-203ENST00000381196 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 ZNF536O15090 1300 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 EMSYQ7Z589 1322 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 CFLARO15519 480 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 PRKCBP05771 671 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-203ENST00000381196 IL32P24001 234 aa4.95□□□□□ -1.62
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