RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM160B2Q86V87 743 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TRPV3Q8NET8 790 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 NANPQ8TBE9 248 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PIGOQ8TEQ8 1089 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 FIG4Q92562 907 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 NAPBQ9H115 298 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 KCND2Q9NZV8 630 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TSPYL4Q9UJ04 414 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 MROH5Q6ZUA9 1318 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 MYH11P35749 1972 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TXNDC9O14530 226 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CDH16O75309 829 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 C6P13671 934 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 GPD2P43304 727 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC12A3P55017 1021 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PSPHP78330 225 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TNFAIP2Q03169 654 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PICALMQ13492 652 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 MORF4L2Q15014 288 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 RABEPKQ7Z6M1 372 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TTC7BQ86TV6 843 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR48Q8TAF3 677 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 HTR3CQ8WXA8 447 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 AZI2Q9H6S1 392 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 OBP2AQ9NY56 170 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 WWOXQ9NZC7 414 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 SNX7Q9UNH6 387 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CRYL1Q9Y2S2 319 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 OAZ2O95190 189 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PFKMP08237 780 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 DRD4P21917 467 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 VHLP40337 213 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 FNTBP49356 437 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 RGS7P49802 495 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CCR9P51686 369 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ARID5AQ03989 594 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 BTKQ06187 659 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 RESTQ13127 1097 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 AAK1Q2M2I8 961 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC37A3Q8NCC5 494 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ACTRT1Q8TDG2 376 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.32e-6■■■□□ 16.6
RABGEF1-202ENST00000380828 ELP4Q96EB1 424 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 RMDN3Q96TC7 470 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 MTFR1LQ9H019 292 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CD274Q9NZQ7 290 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0G2JMP0 313 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A17O43808 307 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP11A1P05108 521 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 MLNP12872 115 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 STAT1P42224 750 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 SERPINB9P50453 376 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 NDUFA8P51970 172 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF45Q02386 682 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CREMQ03060 361 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PTH1RQ03431 593 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC39A6Q13433 755 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 DNAAF5Q86Y56 855 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.93□□□□□ -1.3
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