RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375023.3

NOTCH4-201, Transcript of notch 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOTCH4, Length 6,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4-201ENST00000375023 CAPNS2Q96L46 248 aa14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 PGAM1P18669 254 aa14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 PTPN3P26045 913 aa14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 ITIH4Q14624 930 aa14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 CXorf40AQ8TE69 158 aa14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 VPS33AQ96AX1 596 aa14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 SENP8Q96LD8 212 aa14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 PWWP2AQ96N64 755 aa14.93□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 ALAS2P22557 587 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 ARMC4Q5T2S8 1044 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 RETSATQ6NUM9 610 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 NINJ2Q9NZG7 142 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 ANKDD1BA6NHY2 528 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 ERCC2P18074 760 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 HSPA13P48723 471 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 BIKQ13323 160 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 CNPPD1Q9BV87 410 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 ARMC7Q9H6L4 198 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 GALNT8Q9NY28 637 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 PEX11AO75192 247 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 RENBPP51606 427 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 MADCAM1Q13477 382 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 FAM45BPQ6NSW5 357 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 ACTRT1Q8TDG2 376 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 MRASO14807 208 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 AP5Z1O43299 807 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 HK2P52789 917 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 RAPSNQ13702 412 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 VGLL4Q14135 290 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 AHSPQ9NZD4 102 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 OPTCQ9UBM4 332 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC25A24Q6NUK1 477 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 RGMBQ6NW40 437 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 OR6Y1Q8NGX8 325 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 KANSL3Q9P2N6 904 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 AP4S1Q9Y587 144 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 TBC1D3EA0A087X179 549 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 TBC1D3LB9A6J9 549 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 TBC1D3HP0C7X1 549 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 AKR1A1P14550 325 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 DSELQ8IZU8 1212 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 CFAP52Q8N1V2 620 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 CPS1P31327 1500 aa14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 FGRP09769 529 aa14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 TSPAN19P0C672 248 aa14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 ST13P50502 369 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 RBBP4Q09028 425 aa14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 OR56A4Q8NGH8 313 aa14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 KIFC1Q9BW19 673 aa14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 ENTPD4Q9Y227 616 aa14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 FCHO1O14526 889 aa14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 AOC2O75106 756 aa14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC6A3Q01959 620 aa14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 DMPKQ09013 629 aa14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 ACAP1Q15027 740 aa14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 FEM1CQ96JP0 617 aa14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 ACAT2Q9BWD1 397 aa14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 FUT8Q9BYC5 575 aa14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 ASB8Q9H765 288 aa14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 TRPV2Q9Y5S1 764 aa14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 FFAR2O15552 330 aa14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4-201ENST00000375023 C12orf29Q8N999 325 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms