RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 C22orf23Q9BZE7 217 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRRC4Q9HBW1 653 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 TAAR2Q9P1P5 351 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 CELA1Q9UNI1 258 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 TNFSF13BQ9Y275 285 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF711Q9Y462 761 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 LMTK3Q96Q04 1460 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A087WZ62 844 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ISM1B1AKI9 464 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNJ18B7U540 433 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 NR5A2O00482 541 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 TIMM23O14925 209 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARHGEF9O43307 516 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 MARCH6O60337 910 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLDN7O95471 211 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 PATE4P0C8F1 98 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYZAPP0CAP1 466 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 SRCP12931 536 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 UNGP13051 313 aaPredicted RBP0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC5A1P13866 664 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 BRAFP15056 766 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 DPEP1P16444 411 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSHRP16473 764 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLRC2P26717 231 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 SSTR2P30874 369 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATICP31939 592 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 STAT1P42224 750 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 GSTM5P46439 218 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 CARSP49589 748 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDH12P55289 794 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 CNGA2Q16280 664 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 AAGABQ6PD74 315 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 APOA5Q6Q788 366 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC9B2Q86UD5 537 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGFN1Q86VF2 1251 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 PALB2Q86YC2 1186 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 DPP10Q8N608 796 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM217Q8N7C4 229 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ABHD5Q8WTS1 349 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 PMM1Q92871 262 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF653Q96CK0 615 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLHL29Q96CT2 875 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNX27Q96L92 541 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 FOXN4Q96NZ1 517 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 FSD1Q9BTV5 496 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 CABLES2Q9BTV7 478 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 B3GNT5Q9BYG0 378 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNK9Q9NPC2 374 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF212Q9UDV6 495 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 PHTF1Q9UMS5 762 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAP2CQ9Y3L5 183 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSAG2Q9Y5P2 127 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 GXYLT2A0PJZ3 443 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 E9PQ18 207 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 H7C423 109 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIF3BO15066 747 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 TCEA3O75764 348 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 KDM4BO94953 1096 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 CH25HO95992 272 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGKV3-15P01624 115 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGLV1-44P01699 117 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 LINC00271P0C7V0 271 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYBP10242 640 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACADSP16219 412 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGFBP2P18065 325 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 CD53P19397 219 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms