RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM228AQ86W67 206 aa10.77□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ATL1Q8WXF7 558 aa10.77□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 HTATIP2Q9BUP3 242 aa10.77□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 KCTD10Q9H3F6 313 aa10.77□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 PCYOX1Q9UHG3 505 aa10.77□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 POLIQ9UNA4 740 aa10.77□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa10.77□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 EGFRP00533 1210 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 GSTM1P09488 218 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 MPP3Q13368 585 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 FBXO43Q4G163 708 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 C10orf107Q8IVU9 208 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 IPMKQ8NFU5 416 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 RTKNQ9BST9 563 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 OSBPL7Q9BZF2 842 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 IL22Q9GZX6 179 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 NOTOA8MTQ0 251 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 HMBSP08397 361 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 LMO7Q8WWI1 1683 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 STX16O14662 325 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 GATBO75879 557 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 ADRA2BP18089 450 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 NFKB1P19838 968 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 TXNDC11Q6PKC3 985 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 TCF12Q99081 682 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 G3V2T6 193 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 PGRMC2O15173 223 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 RTP1P59025 263 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAJB8Q8NHS0 232 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 NKX2-3Q8TAU0 364 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 GPR63Q9BZJ6 419 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 MARCH7Q9H992 704 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 NINJ2Q9NZG7 142 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF222Q9UK12 451 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 CPS1P31327 1500 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 NPR2P20594 1047 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 ITGALP20701 1170 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 ADRA1DP25100 572 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 GPD2P43304 727 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 BCAT1P54687 386 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM126BQ8IXS8 530 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 SPIRE2Q8WWL2 714 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 PREBQ9HCU5 417 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 GSG1L2A8MUP6 293 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF879B4DU55 563 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 HS6ST1O60243 411 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 YWHAQP27348 245 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 RPL14P50914 215 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 GRIK3Q13003 919 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 ERFEQ4G0M1 354 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 GRHL2Q6ISB3 625 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 ARMC6Q6NXE6 501 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF276Q8N554 614 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 MEIOBQ8N635 442 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 KBTBD4Q9NVX7 518 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 KIF1AQ12756 1690 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 ITGA2BP08514 1039 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 MYL3P08590 195 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 CXCR2P25025 360 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 POU1F1P28069 291 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 HTRA1Q92743 480 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 RFKQ969G6 155 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 PANX3Q96QZ0 392 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 S100A14Q9HCY8 104 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 GABBR1Q9UBS5 961 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 TSPAN4O14817 238 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 MYBP10242 640 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 DARSP14868 501 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 DGCR6Q14129 220 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 SVOPLQ8N434 492 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 ZFP28Q8NHY6 868 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 SEPHS2Q99611 448 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 AIFM2Q9BRQ8 373 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-201ENST00000356331 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP10.76□□□□□ -0.699e-6■■■■□ 24.8
SH3BP2-201ENST00000356331 CRLS1Q9UJA2 301 aa10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms