RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 TTPAP49638 278 aa9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 SQLEQ14534 574 aa9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 VPS4AQ9UN37 437 aa9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 F8VZ95 297 aa9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 ZCCHC18P0CG32 403 aa9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 BCAP31P51572 246 aa9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 MFSD10Q14728 455 aa9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 KLHL35Q6PF15 583 aa9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 TC2NQ8N9U0 490 aa9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 METTL6Q8TCB7 284 aa9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 CAVIN3Q969G5 261 aa9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 ATG4CQ96DT6 458 aa9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 PPP3R2Q96LZ3 170 aa9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 POMKQ9H5K3 350 aa9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 IDH3BO43837 385 aa9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 CYP2C18P33260 490 aa9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 FAM171A1Q5VUB5 890 aa9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 TXNRD3Q86VQ6 643 aa9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 UBASH3BQ8TF42 649 aa9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 KCNS3Q9BQ31 491 aa9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 HGH1Q9BTY7 390 aa9.46□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 H3BRB1 525 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 OGNP20774 298 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 TTKP33981 857 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 IGFALSP35858 605 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 PJA1Q8NG27 643 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 SYT15Q9BQS2 421 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 MYRFQ9Y2G1 1151 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 CCNDBP1O95273 360 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 LMAN2LQ9H0V9 348 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 MAPK8P45983 427 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 ZMYND11Q15326 602 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 USP41Q3LFD5 358 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 AMER2Q8N7J2 671 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 PHF11Q9UIL8 331 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 GHRP10912 638 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 AMD1P17707 334 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 CORO7P57737 925 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 ATP8B4Q8TF62 1192 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 PNPLA6Q8IY17 1366 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 PRKAR1AP10644 381 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 MYBPC1Q00872 1141 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 DEFB128Q7Z7B8 93 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 LPCAT1Q8NF37 534 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 OR2W6PQ8NHA6 318 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 APBA2Q99767 749 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 DSN1Q9H410 356 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 JMJD4Q9H9V9 463 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 ALOX12P18054 663 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 AQP5P55064 265 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 BRSK2Q8IWQ3 736 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 LGI2Q8N0V4 545 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 HAVCR1Q96D42 359 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 SEPHS2Q99611 448 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 MYL9P24844 172 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 ZNF549Q6P9A3 640 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 HASPINQ8TF76 798 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 SLC25A23Q9BV35 468 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 MCIDASD6RGH6 385 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 CAPGP40121 348 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 RASA2Q15283 850 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 PLA2R1Q13018 1463 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 PARNO95453 639 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 ETS1P14921 441 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 AP1S2P56377 157 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 TMEM86AQ8N2M4 240 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 MYLPFQ96A32 169 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 CDHR5Q9HBB8 845 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 CXCL8P10145 99 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 EPHX2P34913 555 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 MARSP56192 900 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 RFX4Q33E94 735 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 CROCCP3Q8IVE0 287 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 APOPT1Q96IL0 206 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 DAPK2Q9UIK4 370 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 UMODL1Q5DID0 1318 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 PRODHO43272 600 aa9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 SCTRP47872 440 aa9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms