RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 F11P03951 625 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 ERVK-10P10266 1014 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 BRAFP15056 766 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 SP100P23497 879 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 HOXC13P31276 330 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 STAT4Q14765 748 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 POU6F1Q14863 301 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 FSCBQ5H9T9 825 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 IL31Q6EBC2 164 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 SPPL3Q8TCT6 385 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 ARNTL2Q8WYA1 636 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 SMIM14Q96QK8 99 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 FERMT1Q9BQL6 677 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 CHRAC1Q9NRG0 131 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 A0A0U1RQS6 177 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM120BA0PK00 339 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 C2orf71A6NGG8 1288 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 MUSKO15146 869 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 RAMP2O60895 175 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 OAS1P00973 400 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 PRKCGP05129 697 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 RHOQP17081 205 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 MDH1P40925 334 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 DSC2Q02487 901 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 SHHQ15465 462 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 ING5Q8WYH8 240 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 AZIN2Q96A70 460 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 MFSD3Q96ES6 412 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 TTC25Q96NG3 672 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 FOXP3Q9BZS1 431 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 GBA3Q9H227 469 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 SP110Q9HB58 689 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa11.19□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 CCL22O00626 93 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 MATN3O15232 486 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 NCAM2O15394 837 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 CDH16O75309 829 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 PIRTP0C851 137 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 FDFT1P37268 417 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 MSH2P43246 934 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 NUGGCQ68CJ6 796 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 MICALL1Q8N3F8 863 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 WFDC5Q8TCV5 224 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 MAML1Q92585 1016 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 MYRFLQ96LU7 910 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 FICDQ9BVA6 458 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF212Q9UDV6 495 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 CLEC4EQ9ULY5 219 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 PSAT1Q9Y617 370 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 DNAH14Q0VDD8 3507 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 CBX4O00257 560 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 RFXAPO00287 272 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 BUD23O43709 281 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 PEX11BO96011 259 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 TPSB2P20231 275 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 LSP1P33241 339 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 CD86P42081 329 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 PTPRRQ15256 657 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 TPSAB1Q15661 275 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 ARMC3Q5W041 872 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 SRLQ86TD4 932 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 PGBD5Q8N414 524 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 CARNMT1Q8N4J0 409 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 RIN3Q8TB24 985 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 MYLIPQ8WY64 445 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 ACSS3Q9H6R3 686 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM248Q9NWD8 314 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 IGSF9Q9P2J2 1179 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 SNAP91O60641 907 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 GLUD1P00367 558 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 ADH1AP07327 375 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 KRT4P19013 534 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 CCNCP24863 283 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 PHBP35232 272 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 MAGEA3P43357 314 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 SLC11A2P49281 568 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 NIPAL4Q0D2K0 466 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 MROH9Q5TGP6 573 aa11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 LILRA6Q6PI73 481 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms