RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 HIC2Q96JB3 615 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 HAPLN3Q96S86 360 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 CCSER2Q9H7U1 834 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 NPHS2Q9NP85 383 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 ETNK2Q9NVF9 386 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 MTMR10Q9NXD2 777 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 NUMBLQ9Y6R0 609 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 GYG2O15488 501 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 GSC2O15499 205 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 TCEA3O75764 348 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 CETN2P41208 172 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 KRT81Q14533 505 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 PYROXD2Q8N2H3 581 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 SAR1AQ9NR31 198 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 LRG1P02750 347 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 L1CAMP32004 1257 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 CAV1Q03135 178 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 EFEMP1Q12805 493 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 RFX8Q6ZV50 586 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 ITIH5Q86UX2 942 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 NTAN1Q96AB6 310 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 WDCPQ9H6R7 721 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 GRID1Q9ULK0 1009 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 ACTL7BQ9Y614 415 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 CFAP69A5D8W1 941 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 PER2O15055 1255 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 TLR5O60602 858 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 ADRA1BP35368 520 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 PDK2Q15119 407 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 C10orf120Q5SQS8 335 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 SERPINB11Q96P15 392 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 DCTN4Q9UJW0 460 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 OBSL1O75147 1896 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 EPCAMP16422 314 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 IL4RP24394 825 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 SCAPQ12770 1279 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 IZUMO3Q5VZ72 239 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM150AQ86TG1 271 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 SLC22A17Q8WUG5 538 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC77Q9BR77 488 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 TKTL2Q9H0I9 626 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 MAN1C1Q9NR34 630 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 RNF34Q969K3 372 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 ARL8BQ9NVJ2 186 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 AIF1P55008 147 aa20.73■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 PDK4Q16654 411 aa20.73■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 EFHC2Q5JST6 749 aa20.73■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 IZUMO2Q6UXV1 221 aa20.73■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 OTOAQ7RTW8 1153 aa20.73■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 MAP7D3Q8IWC1 876 aa20.73■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 IL21Q9HBE4 155 aa20.73■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 MARCH2Q9P0N8 246 aa20.73■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 CCL16O15467 120 aa20.73■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 ERFP50548 548 aa20.73■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 SPDYAQ5MJ70 313 aa20.73■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 PPM1LQ5SGD2 360 aa20.73■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 MIB1Q86YT6 1006 aa20.73■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa20.73■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 TLR6Q9Y2C9 796 aa20.73■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 EFR3BQ9Y2G0 817 aa20.73■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 RFPL2O75678 378 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 DYNLT1P63172 113 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 ARL13BQ3SXY8 428 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 TMC8Q8IU68 726 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 HS6ST3Q8IZP7 471 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 C4orf33Q8N1A6 199 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 SLC39A13Q96H72 371 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF670Q9BS34 389 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF232Q9UNY5 417 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF510Q9Y2H8 683 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 ZWINTO95229 277 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 F11P03951 625 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 CCR1P32246 355 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 STAT4Q14765 748 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 BRMS1LQ5PSV4 323 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 FYB2Q5VWT5 728 aa20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms