RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 C9orf57Q5W0N0 161 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 STK40Q8N2I9 435 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 FBXO39Q8N4B4 442 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 CPA6Q8N4T0 437 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 PHF21BQ96EK2 531 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 STK39Q9UEW8 545 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 A0A088AWK7 358 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 TMEM114B3SHH9 223 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 APODP05090 189 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 CPA3P15088 417 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 SERPINB5P36952 375 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 PWP1Q13610 501 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 SNX30Q5VWJ9 437 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 OR8H2Q8N162 312 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 OR8D1Q8WZ84 308 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 ASB8Q9H765 288 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 FZD9O00144 591 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 ZNF862O60290 1169 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 KATNA1O75449 491 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 ELK3P41970 407 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 HSPA14Q0VDF9 509 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 TAF10Q12962 218 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 PDPK2PQ6A1A2 396 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 SLC22A9Q8IVM8 553 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 RXFP1Q9HBX9 757 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 ADAM28Q9UKQ2 775 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 GPSM3Q9Y4H4 160 aa14□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 WDR27A2RRH5 827 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 TRIM24O15164 1050 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 RARAP10276 462 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 RBL1P28749 1068 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 CRY1Q16526 586 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 CES3Q6UWW8 571 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 VSTM1Q6UX27 236 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 C12orf29Q8N999 325 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 ACP6Q9NPH0 428 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 CYLDQ9NQC7 956 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 ZSCAN32Q9NX65 697 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 PLK2Q9NYY3 685 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 ZNF510Q9Y2H8 683 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 TBC1D3EA0A087X179 549 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 TBC1D3LB9A6J9 549 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 FAM58BPP0C7Q3 252 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 TBC1D3HP0C7X1 549 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 ACLYP53396 1101 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 NME5P56597 212 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 FUT11Q495W5 492 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 DLK2Q6UY11 383 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 TRIM63Q969Q1 353 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 RIPOR3Q96MK2 946 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 GINS4Q9BRT9 223 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 C11orf49Q9H6J7 331 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 TMEM191CA6NGB0 347 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 SAC3D1A6NKF1 404 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 ASNA1O43681 348 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 MFN2O95140 757 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 BCL10O95999 233 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 OR4Q2P0C623 313 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 PRLRP16471 622 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 FMO4P31512 558 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 CD86P42081 329 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 C21orf59P57076 290 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 SEL1L3Q68CR1 1132 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 DNAJC19Q96DA6 116 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa13.99□□□□□ -0.17
USP22-201ENST00000261497 ETAA1Q9NY74 926 aa13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms