RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
VGF-201ENST00000249330 SELPP16109 830 aa20.57■□□□□ 0.88
VGF-201ENST00000249330 RPL34P49207 117 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
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VGF-201ENST00000249330 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
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VGF-201ENST00000249330 ARPINQ7Z6K5 226 aa20.56■□□□□ 0.88
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VGF-201ENST00000249330 C10orf107Q8IVU9 208 aa20.56■□□□□ 0.88
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VGF-201ENST00000249330 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.56■□□□□ 0.88
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VGF-201ENST00000249330 KRT34O76011 436 aa20.55■□□□□ 0.88
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VGF-201ENST00000249330 ITGA9Q13797 1035 aa20.55■□□□□ 0.88
VGF-201ENST00000249330 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
VGF-201ENST00000249330 CASC4Q6P4E1 433 aa20.55■□□□□ 0.88
VGF-201ENST00000249330 FBXL19Q6PCT2 694 aa20.55■□□□□ 0.88
VGF-201ENST00000249330 CYS1Q717R9 158 aa20.55■□□□□ 0.88
VGF-201ENST00000249330 SLC26A9Q7LBE3 791 aa20.55■□□□□ 0.88
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VGF-201ENST00000249330 SMOQ99835 787 aa20.55■□□□□ 0.88
VGF-201ENST00000249330 OCEL1Q9H607 264 aa20.55■□□□□ 0.88
VGF-201ENST00000249330 IRAK4Q9NWZ3 460 aa20.55■□□□□ 0.88
VGF-201ENST00000249330 TET1Q8NFU7 2136 aa20.55■□□□□ 0.88
VGF-201ENST00000249330 ATP9BO43861 1147 aa20.55■□□□□ 0.88
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VGF-201ENST00000249330 FAM35AQ86V20 835 aa20.54■□□□□ 0.88
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VGF-201ENST00000249330 ALDH1A3P47895 512 aa20.54■□□□□ 0.88
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VGF-201ENST00000249330 CA9Q16790 459 aa20.54■□□□□ 0.88
VGF-201ENST00000249330 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
VGF-201ENST00000249330 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
VGF-201ENST00000249330 ARMC3Q5W041 872 aa20.54■□□□□ 0.88
VGF-201ENST00000249330 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.54■□□□□ 0.88
VGF-201ENST00000249330 OR10T2Q8NGX3 314 aa20.54■□□□□ 0.88
VGF-201ENST00000249330 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
VGF-201ENST00000249330 TBCBQ99426 244 aa20.54■□□□□ 0.88
VGF-201ENST00000249330 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
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