RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 DCLK2Q8N568 766 aa22.77■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 NPWQ8N729 165 aa22.77■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 ATP11CQ8NB49 1132 aa22.77■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 NETO2Q8NC67 525 aa22.77■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 VOPP1Q96AW1 172 aa22.77■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 CSPG4P5Q96PW8 444 aa22.77■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 SLC39A8Q9C0K1 460 aa22.77■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 CEP192Q8TEP8 1941 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 RNF103O00237 685 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 TGM1P22735 817 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 CLCN6P51797 869 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 SERINC3Q13530 473 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 HADHQ16836 314 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 ACCSLQ4AC99 568 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 RETSATQ6NUM9 610 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 ACRBPQ8NEB7 543 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 OR2A12Q8NGT7 310 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.76■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa22.75■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 MCF2LO15068 1137 aa22.75■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 SSR1P43307 286 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 NDST2P52849 883 aa22.75■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB16Q05516 673 aa22.75■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 MMRN1Q13201 1228 aa22.75■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 PARP15Q460N3 678 aa22.75■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 LEKR1Q6ZMV7 388 aa22.75■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.75■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 SARDHQ9UL12 918 aa22.75■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 H3BRJ5 948 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 DAPK3O43293 454 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 METAP1P53582 386 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 CDH6P55285 790 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 DPYSL3Q14195 570 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 CST6Q15828 149 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 C22orf39Q6P5X5 142 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 C11orf74Q86VG3 221 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 TMEFF1Q8IYR6 380 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 LOXL4Q96JB6 756 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 SPACA7Q96KW9 195 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 SERGEFQ9UGK8 458 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 PPM1HQ9ULR3 514 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 HYOU1Q9Y4L1 999 aa22.74■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 A0A0U1RQJ8 604 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 MID1O15344 667 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 CTSLP07711 333 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 RETP07949 1114 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 CD6P30203 668 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 ARL4AP40617 200 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 CHST14Q8NCH0 376 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 RAPGEF5Q92565 580 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 RUBCNQ92622 972 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 CEP44Q9C0F1 390 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 TNKS2Q9H2K2 1166 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 PDFQ9HBH1 243 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 KLHL11Q9NVR0 708 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 DONSONQ9NYP3 566 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 RAB23Q9ULC3 237 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 ALG6Q9Y672 507 aa22.73■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 J3KR12 359 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 PJA2O43164 708 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 RHOBTB1O94844 696 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 EPN2O95208 641 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 DNTTP04053 509 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 KRT7P08729 469 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 ACADMP11310 421 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 COMTP21964 271 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 SLC8A1P32418 973 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 GJC1P36383 396 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 PTGER3P43115 390 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 SPDYCQ5MJ68 293 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 SLC36A4Q6YBV0 504 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 AADATQ8N5Z0 425 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 DEFB119Q8N690 84 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 PCDH19Q8TAB3 1148 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 FAF2Q96CS3 445 aa22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms