RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619750.1

PCDHGA3-203, Transcript of protocadherin gamma subfamily A, 3, humanhuman

APPRIS ALT2 BASIC

Gene PCDHGA3, Length 2,695 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA3-203ENST00000619750 LAMA3Q16787 3333 aa14.61□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.61□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 SETSIPP0DME0 302 aa14.61□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 DPP6P42658 865 aa14.61□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 GRIA4P48058 902 aa14.61□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 TKTL1P51854 596 aa14.61□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 LIMK2P53671 638 aa14.61□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 MPP3Q13368 585 aa14.61□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 PDK1Q15118 436 aa14.61□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 C11orf91Q3C1V1 193 aa14.61□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 ACAD11Q709F0 780 aa14.61□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa14.61□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 MFN1Q8IWA4 741 aa14.61□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 DENND6AQ8IWF6 608 aa14.61□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa14.61□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 NPAS2Q99743 824 aa14.61□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 FTHL17Q9BXU8 183 aa14.61□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 A0A1B0GTW7 788 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 NEMP2A6NFY4 417 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 MEIS3P2A8K0S8 358 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 SLC25A27O95847 323 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 JCHAINP01591 159 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 MLNP12872 115 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 HDCP19113 662 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 ALDH1A3P47895 512 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 MPP1Q00013 466 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 MS4A2Q01362 244 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 POU6F1Q14863 301 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 WSCD1Q658N2 575 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 IYDQ6PHW0 289 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 OPTNQ96CV9 577 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 CDCA5Q96FF9 252 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 BFARQ9NZS9 450 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 DTNAQ9Y4J8 743 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 TRIM13O60858 407 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 USP17L7P0C7H9 530 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 NCAM1P13591 858 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 PMLP29590 882 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 MTTPP55157 894 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 TPI1P60174 286 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 GRTP1Q5TC63 336 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 KIAA0319Q5VV43 1072 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 C4orf22Q6V702 233 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 ARPINQ7Z6K5 226 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 RNF135Q8IUD6 432 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 DSELQ8IZU8 1212 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 ICA1LQ8NDH6 482 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 ULBP1Q9BZM6 244 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 LRRC40Q9H9A6 602 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 CDY2AQ9Y6F7 541 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 TLL2Q9Y6L7 1015 aa14.6□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 KIF3CO14782 793 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 FGFR3P22607 806 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 LAMC2Q13753 1193 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 FLOT2Q14254 428 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 USP10Q14694 798 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 ARHGAP17Q68EM7 881 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 AAGABQ6PD74 315 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 STRADAQ7RTN6 431 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 TMC7Q7Z402 723 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 DCUN1D1Q96GG9 259 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 SIK2Q9H0K1 926 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 CYP4F12Q9HCS2 524 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 DDIT4Q9NX09 232 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 UBAP1Q9NZ09 502 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 SORCS3Q9UPU3 1222 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 TRPA1O75762 1119 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 GLUD2P49448 558 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 PLK1P53350 603 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 SPANXN3Q5MJ09 141 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 C6orf52Q5T4I8 152 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 KBTBD6Q86V97 674 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 DNAJB3Q8WWF6 145 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 HACD1B0YJ81 288 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 PEX1O43933 1283 aa14.59□□□□□ -0.07
PCDHGA3-203ENST00000619750 HUS1O60921 280 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms