RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603304.1

AL355989.2-201, humanhuman

BASIC

Gene AL355989.2, Length 512 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL355989.2-201ENST00000603304 SKOR1P84550 965 aa9.51□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.51□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.51□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 LCLAT1Q6UWP7 414 aa9.51□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 Q6ZVU0 165 aa9.51□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 TAC4Q86UU9 113 aa9.51□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 SLC35F5Q8WV83 523 aa9.51□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 FAM149B1Q96BN6 582 aa9.51□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 SLC39A13Q96H72 371 aa9.51□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 MIS12Q9H081 205 aa9.51□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 WDR70Q9NW82 654 aa9.51□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 DNAJC28Q9NX36 388 aa9.51□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 IL17BQ9UHF5 180 aa9.51□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 KIAA1257Q9ULG3 409 aa9.51□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa9.51□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 U3KQA8 63 aa9.51□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 RELNP78509 3460 aa9.51□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 LRRK1Q38SD2 2015 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 CPED1A4D0V7 1026 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 TCAF2A6NFQ2 919 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 CDRT15L2A8MXV6 281 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 RHOBTB3O94955 611 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 FYNP06241 537 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 EPB41P11171 864 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 CLDN2P57739 230 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 CLN3Q13286 438 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 CDKN3Q16667 212 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 ZNF284Q2VY69 593 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 CBWD6Q4V339 395 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 ZNF542PQ5EBM4 170 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 CBWD3Q5JTY5 395 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 CBWD5Q5RIA9 395 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 TCERG1LQ5VWI1 586 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 TMEM270Q6UE05 265 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 GCNT7Q6ZNI0 430 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 HORMAD1Q86X24 394 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 LURAP1LQ8IV03 231 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 ARL14Q8N4G2 192 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 TFAP2BQ92481 460 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 RNF34Q969K3 372 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 GRAMD1AQ96CP6 724 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 IFT43Q96FT9 208 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 BTN2A3PQ96KV6 586 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 NOX5Q96PH1 765 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 PPM1HQ9ULR3 514 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 LRP4O75096 1905 aa9.5□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 PMS2P1A4D2B8 440 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 A6NNZ2 444 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 H3BM21 787 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 MCF2LO15068 1137 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 SART1O43290 800 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 ATP9BO43861 1147 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 TNFSF15O95150 251 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 PAEPP09466 180 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 PRR29P0C7W0 189 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 PFKFB1P16118 471 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 PLK1P53350 603 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 OXCT1P55809 520 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 CCDC15Q0P6D6 951 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 LRMPQ12912 555 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 DLG2Q15700 870 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 EDRF1Q3B7T1 1238 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 ARL13BQ3SXY8 428 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 ZCWPW2Q504Y3 356 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 RABGAP1LQ5R372 815 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 OR6B2Q6IFH4 312 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 NEK5Q6P3R8 708 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 GUSBP11Q6P575 273 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 CRTC1Q6UUV9 634 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 Q6ZSR6 202 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 CLEC14AQ86T13 490 aa9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
AL355989.2-201ENST00000603304 UBR7Q8N806 425 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms