RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587547.1

NEDD4L-218, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-218ENST00000587547 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 LCMT1Q9UIC8 334 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 ANKRD36A6QL64 1941 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 NAV2Q8IVL1 2488 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 CACNA1EQ15878 2313 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 MEN1O00255 615 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
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NEDD4L-218ENST00000587547 ENDOD1O94919 500 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC2A3P11169 496 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 TIMP2P16035 220 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 MAPK1P28482 360 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 CCR1P32246 355 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 HARS2P49590 506 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 CXCR3P49682 368 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 DNA2P51530 1060 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 ZXDBP98169 803 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 CREB5Q02930 508 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 CCINQ13939 588 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 HADHQ16836 314 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 SMTNL2Q2TAL5 461 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 ARL13BQ3SXY8 428 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF569Q5MCW4 686 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 NUGGCQ68CJ6 796 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 PEX26Q7Z412 305 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 DENND1CQ8IV53 801 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 SYCE1Q8N0S2 351 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 CCDC185Q8N715 623 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 LRRC57Q8N9N7 239 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 HSPH1Q92598 858 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 RSPRY1Q96DX4 576 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC39A13Q96H72 371 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 TKTL2Q9H0I9 626 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 SIK2Q9H0K1 926 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 KLHL11Q9NVR0 708 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 AMFRQ9UKV5 643 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 SNX10Q9Y5X0 201 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 ALG6Q9Y672 507 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 HEPACAM2A8MVW5 462 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 DCLK1O15075 740 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 PAGE1O75459 146 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 IGLV3-27P01718 113 aa8.69□□□□□ -1.02
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NEDD4L-218ENST00000587547 MPSTP25325 297 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 IL1R2P27930 398 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 PCK1P35558 622 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC1A1P43005 524 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 MARCKSL1P49006 195 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC11A2P49281 568 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 RELBQ01201 579 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 PON2Q15165 354 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF77Q15935 545 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 EFHC2Q5JST6 749 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 DGKKQ5KSL6 1271 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 BRMS1LQ5PSV4 323 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 COX20Q5RI15 118 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 RAP1GAP2Q684P5 730 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 BNIPLQ7Z465 357 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 SLFN11Q7Z7L1 901 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 CHSY1Q86X52 802 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 UNC45BQ8IWX7 931 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 BBS7Q8IWZ6 715 aa8.69□□□□□ -1.02
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NEDD4L-218ENST00000587547 SLC35F6Q8N357 371 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 TRIM58Q8NG06 486 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 TTC8Q8TAM2 541 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 RIN3Q8TB24 985 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 NCAPGQ9BPX3 1015 aa8.69□□□□□ -1.02
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NEDD4L-218ENST00000587547 MAGEB5Q9BZ81 275 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 DCLK3Q9C098 648 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 KIF9Q9HAQ2 790 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 TMEM9BQ9NQ34 198 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 ANLNQ9NQW6 1124 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 FZD10Q9ULW2 581 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD4L-218ENST00000587547 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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