RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	GRIK3	Q13003	919 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	SMO	Q99835	787 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	RTKN	Q9BST9	563 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PDP2	Q9P2J9	529 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	DCX	O43602	365 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	USP17L7	P0C7H9	530 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	COX4I1	P13073	169 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	XIAP	P98170	497 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB17	Q13105	803 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	STON2	Q8WXE9	905 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PCED1B	Q96HM7	432 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	KCNK16	Q96T55	309 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	GPR22	Q99680	433 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CDH9	Q9ULB4	789 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	E2F8	A0AVK6	867 aa		18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559		I6L893	689 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	NUMB	P49757	651 aa		18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	EPHB1	P54762	984 aa		18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	USP4	Q13107	963 aa		18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	UGP2	Q16851	508 aa		18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	AZIN2	Q96A70	460 aa		18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	ZFP42	Q96MM3	310 aa		18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	KIFC1	Q9BW19	673 aa		18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		18.75	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	SLC22A2	O15244	555 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	COL6A2	P12110	1019 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	ITGAX	P20702	1163 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	POLD2	P49005	469 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	TUB	P50607	506 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CACNA2D1	P54289	1103 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	ASPH	Q12797	758 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	KLF10	Q13118	480 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CUL3	Q13618	768 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	RAPH1	Q70E73	1250 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	ASB3	Q9Y575	518 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CABYR	O75952	493 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	JCHAIN	P01591	159 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	THRA	P10827	490 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PCSK1	P29120	753 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CYP2C18	P33260	490 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	IRF9	Q00978	393 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CDC16	Q13042	620 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	LIPM	Q5VYY2	423 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CNDP1	Q96KN2	507 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	TSGA13	Q96PP4	275 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	DRC3	Q9H069	523 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		18.74	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	MATN2	O00339	956 aa		18.73	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	HDAC3	O15379	428 aa		18.73	■□□□□ 0.59

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